More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1164 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  100 
 
 
501 aa  1037    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  60.29 
 
 
524 aa  617  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03210  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.73 
 
 
521 aa  180  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  30.84 
 
 
505 aa  140  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  28.07 
 
 
498 aa  136  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  27.3 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  30 
 
 
386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  29.75 
 
 
601 aa  127  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  25.66 
 
 
453 aa  126  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.11 
 
 
595 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  27.92 
 
 
362 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  34.04 
 
 
356 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  28.85 
 
 
377 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  30.42 
 
 
526 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  26.89 
 
 
497 aa  118  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  31.36 
 
 
441 aa  116  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.99 
 
 
559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  26.7 
 
 
486 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.94 
 
 
544 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.09 
 
 
453 aa  114  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  24.66 
 
 
513 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  28.03 
 
 
342 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  28.45 
 
 
475 aa  114  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  27.67 
 
 
463 aa  113  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  26.32 
 
 
498 aa  113  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  26.32 
 
 
498 aa  113  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  26.95 
 
 
662 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  26.28 
 
 
1032 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  28.65 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  26.32 
 
 
481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.71 
 
 
493 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  26.98 
 
 
463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  26.59 
 
 
481 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  26.59 
 
 
481 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  26.42 
 
 
514 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  28.66 
 
 
537 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  26.35 
 
 
378 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  31.8 
 
 
440 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  30.89 
 
 
513 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  26.33 
 
 
338 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  31.02 
 
 
487 aa  110  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.27 
 
 
488 aa  110  8.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  27.02 
 
 
462 aa  110  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  29.7 
 
 
513 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  28.93 
 
 
848 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  26.32 
 
 
463 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  25.39 
 
 
485 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  29.43 
 
 
513 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  27.09 
 
 
450 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  25.25 
 
 
519 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  26.45 
 
 
669 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3187  beta-lactamase  27.86 
 
 
454 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000216369  hitchhiker  0.000000000911992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  25.99 
 
 
588 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  27.38 
 
 
490 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  27.41 
 
 
351 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  28.45 
 
 
477 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  28.85 
 
 
451 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  26.51 
 
 
446 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  29.22 
 
 
650 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  26.5 
 
 
483 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  25.76 
 
 
481 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  24.79 
 
 
717 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  29.34 
 
 
513 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  30.28 
 
 
498 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  33.61 
 
 
533 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.66 
 
 
442 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  31.53 
 
 
614 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  24.73 
 
 
482 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  29.69 
 
 
447 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  27.51 
 
 
414 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  24.73 
 
 
482 aa  103  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  28.77 
 
 
613 aa  103  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.74 
 
 
392 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  27.16 
 
 
391 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.84 
 
 
520 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  28.87 
 
 
497 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  26.86 
 
 
529 aa  100  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  25.5 
 
 
367 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27 
 
 
364 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  28.35 
 
 
445 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  27.4 
 
 
633 aa  100  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  26.89 
 
 
361 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  26.65 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  25.82 
 
 
485 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  26.65 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  26.65 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  26.54 
 
 
427 aa  99.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  25.26 
 
 
635 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0411  beta-lactam binding protein AmpH  26.14 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  26.65 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  24.37 
 
 
470 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  26.65 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  27.56 
 
 
711 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.19 
 
 
484 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0409  beta-lactam binding protein AmpH  26.14 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225371  hitchhiker  0.000170283 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  26.65 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  26.65 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0471  beta-lactam binding protein AmpH  26.14 
 
 
385 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal  0.181498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  29.55 
 
 
600 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  27.81 
 
 
530 aa  99.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>