More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3731 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  100 
 
 
603 aa  1194    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  96.12 
 
 
593 aa  1060    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  83.74 
 
 
611 aa  929    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  31.82 
 
 
578 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  40.23 
 
 
487 aa  256  8e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.38 
 
 
392 aa  219  8.999999999999998e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.8 
 
 
442 aa  216  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  31.21 
 
 
446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  38.73 
 
 
445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  36.04 
 
 
369 aa  204  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  35.38 
 
 
477 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  35.17 
 
 
434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  38.61 
 
 
356 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  35.74 
 
 
482 aa  182  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  29.68 
 
 
417 aa  180  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  35.31 
 
 
470 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  29.79 
 
 
446 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  31.99 
 
 
450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  29.93 
 
 
442 aa  166  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  30.29 
 
 
431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  33.54 
 
 
848 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  30.77 
 
 
342 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  27.55 
 
 
415 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  27.41 
 
 
413 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  28.57 
 
 
404 aa  160  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  27.1 
 
 
422 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  27.1 
 
 
421 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  27.1 
 
 
416 aa  159  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  34.59 
 
 
338 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  27.78 
 
 
412 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  27.78 
 
 
416 aa  159  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  27.1 
 
 
421 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  27.1 
 
 
412 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  26.79 
 
 
413 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  35.02 
 
 
361 aa  157  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  31.03 
 
 
537 aa  153  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  29.79 
 
 
325 aa  153  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  33.55 
 
 
713 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  29.22 
 
 
362 aa  151  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  33.62 
 
 
476 aa  151  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  32.16 
 
 
330 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  27.6 
 
 
378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  27.89 
 
 
378 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.54 
 
 
406 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  26.56 
 
 
375 aa  146  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.5 
 
 
559 aa  146  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  29.46 
 
 
376 aa  146  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.98 
 
 
445 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  32.36 
 
 
377 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  27.98 
 
 
378 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.56 
 
 
420 aa  144  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  32.54 
 
 
389 aa  143  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  31.4 
 
 
422 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  28.7 
 
 
375 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  32.61 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  27.54 
 
 
379 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  33.24 
 
 
382 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  30.36 
 
 
377 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  30.36 
 
 
377 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  30.36 
 
 
377 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  30.21 
 
 
364 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  30.24 
 
 
467 aa  140  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  34.44 
 
 
475 aa  140  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  30.36 
 
 
377 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  29.71 
 
 
375 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  24.94 
 
 
543 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  24.94 
 
 
543 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  30.36 
 
 
375 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  30.06 
 
 
377 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  30.36 
 
 
377 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.31 
 
 
388 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  29.29 
 
 
415 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  32.28 
 
 
363 aa  137  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  31.62 
 
 
367 aa  137  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  30.21 
 
 
375 aa  137  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.69 
 
 
413 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  30.82 
 
 
410 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  29.78 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.7 
 
 
383 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  31.16 
 
 
370 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  29.22 
 
 
340 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  34.25 
 
 
720 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  28.92 
 
 
348 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  31.97 
 
 
388 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  28.92 
 
 
340 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  33.58 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  33.21 
 
 
388 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  31.64 
 
 
740 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  29.64 
 
 
462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  33.33 
 
 
321 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.39 
 
 
378 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  35.31 
 
 
392 aa  132  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.63 
 
 
389 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.53 
 
 
389 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.58 
 
 
407 aa  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  31.63 
 
 
388 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  32.75 
 
 
369 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  31.63 
 
 
388 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  30.84 
 
 
378 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.27 
 
 
388 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>