More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3175 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  100 
 
 
351 aa  724    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  38.8 
 
 
330 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  38.21 
 
 
537 aa  222  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  39.06 
 
 
330 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  34.47 
 
 
559 aa  200  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  32.1 
 
 
364 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.84 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  33.93 
 
 
371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  31.68 
 
 
543 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  31.68 
 
 
543 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.68 
 
 
356 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  33.87 
 
 
362 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  31.05 
 
 
547 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  28.89 
 
 
402 aa  149  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  28.57 
 
 
543 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  32.42 
 
 
445 aa  142  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.97 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  29.75 
 
 
477 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  27.89 
 
 
330 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  30.72 
 
 
470 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  28.67 
 
 
342 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  30.82 
 
 
364 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  30.36 
 
 
325 aa  136  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  33.79 
 
 
358 aa  136  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  26.57 
 
 
338 aa  135  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  30.95 
 
 
487 aa  133  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  30.23 
 
 
848 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  29.34 
 
 
553 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  29.81 
 
 
369 aa  126  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  28.9 
 
 
462 aa  126  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  32.12 
 
 
446 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  30.87 
 
 
578 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  25.23 
 
 
369 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  30.03 
 
 
603 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  28.57 
 
 
482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.04 
 
 
593 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  29.04 
 
 
415 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  31.15 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  30.66 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  29.68 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  26.84 
 
 
524 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  28.69 
 
 
434 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  28.02 
 
 
611 aa  113  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  29.1 
 
 
417 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  30 
 
 
450 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28 
 
 
392 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  30.14 
 
 
371 aa  112  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  27.18 
 
 
403 aa  112  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  30.31 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  31.64 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  31.49 
 
 
443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.71 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  31.64 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  31.64 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  31.64 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  29 
 
 
446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  28.66 
 
 
453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  25.66 
 
 
389 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  30.84 
 
 
366 aa  109  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  29.78 
 
 
375 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  28.99 
 
 
371 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  27.83 
 
 
341 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  27.76 
 
 
567 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  30.33 
 
 
321 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  25.85 
 
 
378 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  29.47 
 
 
375 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.41 
 
 
501 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  27.78 
 
 
341 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  26.85 
 
 
380 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  31.93 
 
 
375 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  32.33 
 
 
388 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  31.93 
 
 
377 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.56 
 
 
389 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  31.95 
 
 
388 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  29.78 
 
 
486 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  28.49 
 
 
834 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1378  beta-lactamase  29.88 
 
 
337 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.389159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  31 
 
 
389 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  28.66 
 
 
376 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  30.91 
 
 
713 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  30.18 
 
 
388 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.18 
 
 
389 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  30.18 
 
 
388 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.77 
 
 
407 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.42 
 
 
385 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  28.04 
 
 
476 aa  102  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  30.18 
 
 
388 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  28.15 
 
 
378 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  29.5 
 
 
494 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  27.81 
 
 
463 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.42 
 
 
385 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.77 
 
 
407 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  31.31 
 
 
514 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.28 
 
 
508 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  30 
 
 
431 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  28.15 
 
 
378 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  29.62 
 
 
416 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.42 
 
 
385 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  30.42 
 
 
385 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.4 
 
 
529 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>