More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4350 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  100 
 
 
553 aa  1117    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  49.27 
 
 
547 aa  522  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  29.26 
 
 
537 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  26.58 
 
 
559 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  25.97 
 
 
543 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  25.97 
 
 
543 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  33.43 
 
 
356 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.44 
 
 
487 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  33.03 
 
 
378 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  28.65 
 
 
543 aa  137  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  29.34 
 
 
351 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0947  D-aminopeptidase  29.55 
 
 
518 aa  124  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0889  D-aminopeptidase  29.29 
 
 
518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1412  D-aminopeptidase  29.59 
 
 
520 aa  118  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  30 
 
 
453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  31 
 
 
498 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  27.88 
 
 
330 aa  113  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25.34 
 
 
578 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  34.3 
 
 
611 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  29.27 
 
 
338 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  29.07 
 
 
362 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  29.55 
 
 
364 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  24.77 
 
 
477 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  28.16 
 
 
330 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  28.11 
 
 
402 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  35.02 
 
 
371 aa  107  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  28.85 
 
 
369 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  23.49 
 
 
342 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.94 
 
 
493 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  32.65 
 
 
603 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  26.88 
 
 
462 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29 
 
 
480 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  30.59 
 
 
367 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  26.83 
 
 
470 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  25.09 
 
 
417 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  32.17 
 
 
593 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3246  D-aminopeptidase  28.27 
 
 
516 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  29.65 
 
 
369 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  28.65 
 
 
364 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.18 
 
 
392 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3981  D-aminopeptidase  27.74 
 
 
516 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  25.65 
 
 
485 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  28.02 
 
 
480 aa  100  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  23.32 
 
 
434 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  30.71 
 
 
476 aa  97.8  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  27.43 
 
 
848 aa  97.1  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  30.67 
 
 
499 aa  97.1  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  26.56 
 
 
366 aa  96.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  25.05 
 
 
496 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  22.96 
 
 
446 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  33.85 
 
 
510 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  27.69 
 
 
462 aa  95.1  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.96 
 
 
442 aa  94.7  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  26.75 
 
 
519 aa  94.7  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  27.51 
 
 
485 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  29.52 
 
 
445 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  30.27 
 
 
513 aa  93.6  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  29.03 
 
 
513 aa  93.6  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.13 
 
 
595 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.93 
 
 
401 aa  93.2  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  35.56 
 
 
363 aa  93.2  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  26.29 
 
 
464 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  28.21 
 
 
588 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  25.25 
 
 
485 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  25.39 
 
 
513 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  27.03 
 
 
450 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  27.51 
 
 
330 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  25.07 
 
 
485 aa  90.9  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  23.75 
 
 
446 aa  90.9  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  24.44 
 
 
431 aa  90.9  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  26.05 
 
 
662 aa  90.1  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.16 
 
 
601 aa  89  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  28.12 
 
 
375 aa  89.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  28.14 
 
 
658 aa  88.6  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  25.5 
 
 
485 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0059  beta-lactamase  24.43 
 
 
383 aa  87.8  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  22.99 
 
 
483 aa  87.8  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  24.4 
 
 
415 aa  87.4  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  25.5 
 
 
485 aa  87.4  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  25.5 
 
 
485 aa  87.4  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  26.03 
 
 
485 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  24.79 
 
 
529 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  27.98 
 
 
377 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  25.25 
 
 
485 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  27.23 
 
 
377 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  27.98 
 
 
377 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  27.98 
 
 
377 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  32.46 
 
 
519 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1876  beta-lactamase  30.88 
 
 
493 aa  86.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  28.44 
 
 
457 aa  86.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  30.09 
 
 
533 aa  86.7  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  27.71 
 
 
463 aa  86.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  27.18 
 
 
455 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  26.05 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  26.1 
 
 
421 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.05 
 
 
421 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  26.1 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  29.46 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  25.4 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  27.52 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>