More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0860 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  100 
 
 		 457 aa  895    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  48.25 
 
 		 475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  47.53 
 
 		 488 aa  320  1.9999999999999998e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0126  beta-lactamase  38.6 
 
 		 456 aa  242  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  33.73 
 
 		 462 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30360  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.16 
 
 		 550 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  33.15 
 
 		 498 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01490  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.5 
 
 		 460 aa  122  9e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.697704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  34.01 
 
 		 603 aa  119  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  27.25 
 
 		 524 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.14 
 
 		 514 aa  117  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  33.33 
 
 		 593 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  35.37 
 
 		 611 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  35.84 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.7 
 
 		 529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  28.71 
 
 		 470 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  30.36 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  31.45 
 
 		 451 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  25.88 
 
 		 1032 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.03 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  32.62 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  30.18 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  29.19 
 
 		 388 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  29.19 
 
 		 388 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.19 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25.41 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.37 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.41 
 
 		 559 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.13 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  30.29 
 
 		 530 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  28.57 
 
 		 519 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.19 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  29.19 
 
 		 388 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  34.55 
 
 		 467 aa  106  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  26.59 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  30.27 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  24.56 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  27.36 
 
 		 475 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.03 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  30.94 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  33.33 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  27.8 
 
 		 388 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.8 
 
 		 389 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  26.98 
 
 		 537 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  27.8 
 
 		 388 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  25.55 
 
 		 601 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  27.3 
 
 		 482 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  26.98 
 
 		 482 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  29.95 
 
 		 461 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.69 
 
 		 595 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  24.93 
 
 		 505 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.33 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  30.51 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  22.8 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3187  beta-lactamase  33.96 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000216369  hitchhiker  0.000000000911992 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  29.68 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  27.49 
 
 		 483 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  29.55 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.94 
 
 		 513 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2708  beta-lactamase  33.52 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.93 
 
 		 392 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  24.86 
 
 		 434 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.27 
 
 		 442 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  29.65 
 
 		 635 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  26.28 
 
 		 498 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  33.55 
 
 		 333 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  26.28 
 
 		 498 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  24.47 
 
 		 442 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  25.73 
 
 		 614 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  30.21 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  29.48 
 
 		 2457 aa  99  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  30.98 
 
 		 450 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  25.27 
 
 		 526 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  36.36 
 
 		 441 aa  98.2  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.03 
 
 		 385 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  30.67 
 
 		 366 aa  97.4  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  26.62 
 
 		 450 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03210  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.41 
 
 		 521 aa  97.1  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  30.94 
 
 		 388 aa  97.1  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.5 
 
 		 385 aa  97.1  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  30.32 
 
 		 388 aa  97.1  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  30.94 
 
 		 388 aa  97.1  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.32 
 
 		 388 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  24.86 
 
 		 486 aa  97.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  25.15 
 
 		 351 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  22.73 
 
 		 669 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  25.21 
 
 		 453 aa  96.7  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  29.21 
 
 		 378 aa  96.7  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  29.83 
 
 		 720 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  27.88 
 
 		 362 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.83 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  24.76 
 
 		 543 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  30.83 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  29.5 
 
 		 464 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.94 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  26.28 
 
 		 412 aa  95.1  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  29.87 
 
 		 369 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  30.92 
 
 		 375 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  31.35 
 
 		 740 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.34 
 
 		 497 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>