More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4546 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  100 
 
 		 740 aa  1495    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  69.67 
 
 		 381 aa  525  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  53.23 
 
 		 438 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  52.76 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  52.83 
 
 		 405 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  52.83 
 
 		 405 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3053  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  45.2 
 
 		 420 aa  292  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  45.14 
 
 		 429 aa  289  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  42.42 
 
 		 467 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.19 
 
 		 420 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  44.61 
 
 		 420 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  43.82 
 
 		 420 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  42.43 
 
 		 416 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.68 
 
 		 447 aa  231  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  39.41 
 
 		 447 aa  227  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.41 
 
 		 447 aa  227  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.75 
 
 		 406 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  39.85 
 
 		 670 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  40.4 
 
 		 669 aa  180  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.12 
 
 		 399 aa  174  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  40.08 
 
 		 688 aa  165  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.63 
 
 		 378 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  41.56 
 
 		 713 aa  164  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  39.17 
 
 		 349 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.94 
 
 		 415 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.81 
 
 		 413 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  30.46 
 
 		 371 aa  155  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.42 
 
 		 514 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  37.25 
 
 		 693 aa  154  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  29.68 
 
 		 371 aa  153  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  34.08 
 
 		 370 aa  153  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  35.52 
 
 		 680 aa  153  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  36.84 
 
 		 485 aa  153  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  32.49 
 
 		 378 aa  151  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.8 
 
 		 390 aa  151  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  35.21 
 
 		 374 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  30.46 
 
 		 405 aa  148  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  32.48 
 
 		 656 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  33.43 
 
 		 443 aa  147  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  32.54 
 
 		 429 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.96 
 
 		 416 aa  146  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  35.79 
 
 		 475 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2537  beta-lactamase  33.42 
 
 		 393 aa  146  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  32.22 
 
 		 406 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.91 
 
 		 388 aa  145  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  31.12 
 
 		 720 aa  144  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1771  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.92 
 
 		 380 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.1791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  34.14 
 
 		 392 aa  142  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  32.14 
 
 		 389 aa  140  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  40.18 
 
 		 668 aa  140  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  30.7 
 
 		 388 aa  140  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  29.79 
 
 		 388 aa  139  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.69 
 
 		 389 aa  138  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.02 
 
 		 388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  29.61 
 
 		 388 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  31.33 
 
 		 539 aa  134  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.19 
 
 		 391 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  29.31 
 
 		 388 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.31 
 
 		 389 aa  134  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  29.31 
 
 		 388 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  35.89 
 
 		 480 aa  133  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  29.31 
 
 		 388 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.13 
 
 		 414 aa  133  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.4 
 
 		 389 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  29.49 
 
 		 414 aa  131  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.11 
 
 		 407 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  29.15 
 
 		 535 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  29.15 
 
 		 535 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  29.19 
 
 		 434 aa  130  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.11 
 
 		 385 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  29 
 
 		 388 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  30.4 
 
 		 375 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  34.29 
 
 		 449 aa  129  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.38 
 
 		 442 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  29.2 
 
 		 539 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.89 
 
 		 407 aa  128  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  31.85 
 
 		 382 aa  128  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.03 
 
 		 383 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  35.71 
 
 		 378 aa  127  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  29.57 
 
 		 445 aa  126  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  30.16 
 
 		 521 aa  126  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.99 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  30.67 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.67 
 
 		 385 aa  126  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  28.33 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  30.99 
 
 		 385 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  30.31 
 
 		 397 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  29.91 
 
 		 409 aa  124  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  32 
 
 		 612 aa  124  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.51 
 
 		 383 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  32 
 
 		 428 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.72 
 
 		 421 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2625  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.96 
 
 		 417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  30 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  29.02 
 
 		 388 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  28.7 
 
 		 388 aa  122  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.7 
 
 		 388 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  29.02 
 
 		 388 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2315  beta-lactamase  30.8 
 
 		 440 aa  122  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00477679  hitchhiker  0.0000358597 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.02 
 
 		 388 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>