More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0126 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0126  beta-lactamase  100 
 
 		 456 aa  927    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  49.12 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  35.34 
 
 		 475 aa  233  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  38.72 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  37.02 
 
 		 488 aa  218  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30360  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  37.75 
 
 		 550 aa  178  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  29.3 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  29.29 
 
 		 2457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.58 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  24.86 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  30.72 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.1 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  28 
 
 		 497 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  29.9 
 
 		 356 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  24.85 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  28.67 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.79 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  24.46 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.69 
 
 		 477 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.23 
 
 		 367 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  26.24 
 
 		 526 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  27.96 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  25.7 
 
 		 501 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.28 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  27.25 
 
 		 524 aa  96.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.24 
 
 		 392 aa  97.1  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  26.63 
 
 		 470 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  26.27 
 
 		 388 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  29.85 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  27.42 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  28.4 
 
 		 369 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  25 
 
 		 520 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.94 
 
 		 593 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  27.42 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  27.94 
 
 		 429 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  24.7 
 
 		 595 aa  94.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.69 
 
 		 529 aa  94.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.75 
 
 		 476 aa  94.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  27.58 
 
 		 513 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  22.61 
 
 		 505 aa  94  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  32.69 
 
 		 370 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.22 
 
 		 514 aa  93.6  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  28.31 
 
 		 713 aa  93.6  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.42 
 
 		 389 aa  93.6  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  23.44 
 
 		 434 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  27.42 
 
 		 388 aa  93.2  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  27.42 
 
 		 388 aa  93.2  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.35 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  28.34 
 
 		 349 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  36.47 
 
 		 603 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  24.86 
 
 		 498 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  23.65 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  30.45 
 
 		 392 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3187  beta-lactamase  27.99 
 
 		 454 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000216369  hitchhiker  0.000000000911992 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  24.86 
 
 		 498 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.09 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  27.94 
 
 		 401 aa  91.3  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.97 
 
 		 388 aa  90.5  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  28.89 
 
 		 467 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  27.08 
 
 		 443 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  27.74 
 
 		 388 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1501  beta-lactamase  26.19 
 
 		 447 aa  90.1  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130484  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  31.23 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.72 
 
 		 544 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  27.04 
 
 		 388 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.08 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  26.42 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  26.42 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  26.42 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  35.88 
 
 		 611 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.42 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  26.85 
 
 		 389 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.42 
 
 		 388 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  26.23 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  29.87 
 
 		 321 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  23.51 
 
 		 446 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  21.96 
 
 		 486 aa  87.4  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  27.93 
 
 		 519 aa  87.4  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.82 
 
 		 389 aa  87.4  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.02 
 
 		 453 aa  87  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.9 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  26.63 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.07 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.81 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  23.82 
 
 		 383 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.3 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  26.32 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  25.69 
 
 		 588 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  30.84 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  28.05 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  21.78 
 
 		 1032 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  26.84 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  26.07 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  29.87 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  27.3 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.41 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  24.79 
 
 		 669 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.41 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  27.34 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.07 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>