More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6206 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  100 
 
 		 321 aa  662    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.21 
 
 		 442 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  33.22 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  33.22 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  35.37 
 
 		 445 aa  159  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  32.45 
 
 		 487 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  36.15 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  32.35 
 
 		 362 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  31.8 
 
 		 578 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  32.91 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.62 
 
 		 392 aa  145  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  33.44 
 
 		 611 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  33.33 
 
 		 593 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  33.33 
 
 		 603 aa  139  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  30.14 
 
 		 404 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  30.1 
 
 		 417 aa  135  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  28.67 
 
 		 482 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  30.79 
 
 		 559 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  32.69 
 
 		 363 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  30.19 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  32.7 
 
 		 537 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  29.11 
 
 		 421 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.11 
 
 		 421 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  29.11 
 
 		 412 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  29.11 
 
 		 412 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  30.14 
 
 		 378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  26.71 
 
 		 434 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  29.11 
 
 		 416 aa  129  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  28.77 
 
 		 422 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  30.17 
 
 		 462 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  28.77 
 
 		 413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  29.39 
 
 		 446 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  28.9 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  28.67 
 
 		 416 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  29.01 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  30 
 
 		 848 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  28.42 
 
 		 413 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  33.08 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4697  beta-lactamase  29.39 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.168974  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  31.02 
 
 		 470 aa  122  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  30 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.71 
 
 		 477 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  30.23 
 
 		 510 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  29.13 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  29.13 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  30.03 
 
 		 403 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  29.13 
 
 		 340 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  29.13 
 
 		 340 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  29.48 
 
 		 544 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  30.33 
 
 		 351 aa  119  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  28.76 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  28.76 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  27.55 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  31.34 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  27.81 
 
 		 520 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  30.58 
 
 		 395 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  28.8 
 
 		 340 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  26.43 
 
 		 378 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  25.87 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  28.43 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  33.57 
 
 		 590 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  26.11 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  26.52 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  27.15 
 
 		 410 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  31.42 
 
 		 476 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  26.43 
 
 		 376 aa  109  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  30.69 
 
 		 364 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.98 
 
 		 453 aa  108  9.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  28.92 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  29.64 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  28.28 
 
 		 442 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  26.2 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.53 
 
 		 595 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  25.94 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  27.33 
 
 		 543 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  29.71 
 
 		 401 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  27.33 
 
 		 543 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  28.86 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  29.47 
 
 		 422 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  38.2 
 
 		 371 aa  105  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  26.21 
 
 		 513 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  22.58 
 
 		 483 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  25.47 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  31.88 
 
 		 662 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  27.12 
 
 		 450 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.94 
 
 		 480 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  27.92 
 
 		 443 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  24.84 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  24.84 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  31.03 
 
 		 2457 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  29.45 
 
 		 377 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  24.92 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.78 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5107  beta-lactamase  27.62 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434559  normal  0.256673 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  28.81 
 
 		 366 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0126  beta-lactamase  29.87 
 
 		 456 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  30.15 
 
 		 519 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  28.77 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  25.71 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.68 
 
 		 493 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>