More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3287 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  100 
 
 		 463 aa  889    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  55.34 
 
 		 451 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  52.71 
 
 		 450 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  51.97 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  49.25 
 
 		 467 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  53.58 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3187  beta-lactamase  49.46 
 
 		 454 aa  361  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000216369  hitchhiker  0.000000000911992 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2708  beta-lactamase  42.39 
 
 		 417 aa  268  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01490  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  36.47 
 
 		 460 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.697704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1501  beta-lactamase  35.15 
 
 		 447 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130484  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  28.46 
 
 		 524 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  31.58 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  29.07 
 
 		 498 aa  114  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.67 
 
 		 501 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  21.68 
 
 		 505 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.23 
 
 		 477 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  26.92 
 
 		 578 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  35.24 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.35 
 
 		 480 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.31 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  30.03 
 
 		 530 aa  104  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  23.94 
 
 		 353 aa  103  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.16 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  21.39 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  21.39 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  28.12 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  30.67 
 
 		 446 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  23.24 
 
 		 487 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.75 
 
 		 595 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  28.91 
 
 		 603 aa  100  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.18 
 
 		 378 aa  99.8  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  31.55 
 
 		 463 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  25.36 
 
 		 325 aa  99.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  24.93 
 
 		 386 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  26.04 
 
 		 590 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  26.13 
 
 		 588 aa  97.8  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  27.34 
 
 		 445 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  28.75 
 
 		 460 aa  97.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.5 
 
 		 601 aa  96.7  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  29.45 
 
 		 445 aa  97.1  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  21.19 
 
 		 446 aa  96.7  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  28.14 
 
 		 611 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.76 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.52 
 
 		 513 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  26.92 
 
 		 483 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  28.16 
 
 		 593 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  29.02 
 
 		 717 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  25.97 
 
 		 367 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  24.06 
 
 		 462 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.06 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  29.22 
 
 		 5698 aa  94  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  29.23 
 
 		 478 aa  93.6  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  30.15 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  29.48 
 
 		 480 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  27.84 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  31.1 
 
 		 525 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  22.42 
 
 		 481 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03210  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.21 
 
 		 521 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  23.38 
 
 		 1032 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  30.03 
 
 		 497 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.67 
 
 		 493 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.27 
 
 		 413 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  22.87 
 
 		 463 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  22.59 
 
 		 490 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  23.82 
 
 		 520 aa  91.3  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  22.35 
 
 		 1055 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  27.06 
 
 		 580 aa  90.1  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  25.37 
 
 		 369 aa  89.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  21.91 
 
 		 481 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  21.91 
 
 		 481 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  22.84 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  22.31 
 
 		 483 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  28.75 
 
 		 456 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  23.03 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  24.65 
 
 		 614 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  28.32 
 
 		 694 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  29.05 
 
 		 711 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  31.34 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  26.29 
 
 		 650 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  21.45 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  27.76 
 
 		 470 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.52 
 
 		 416 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  21.65 
 
 		 481 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  23.97 
 
 		 544 aa  87.8  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  30.05 
 
 		 507 aa  87.8  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  26.77 
 
 		 356 aa  87.8  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  22.28 
 
 		 483 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  28.61 
 
 		 460 aa  87  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  29.7 
 
 		 389 aa  87  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  27.71 
 
 		 553 aa  86.7  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  28.04 
 
 		 507 aa  86.7  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  21.13 
 
 		 543 aa  86.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  21.13 
 
 		 543 aa  86.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.28 
 
 		 582 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  23.49 
 
 		 514 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0126  beta-lactamase  26.84 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  28.69 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  25.3 
 
 		 494 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  28.77 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  25.36 
 
 		 600 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>