More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4308 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  100 
 
 
650 aa  1309    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  41.58 
 
 
778 aa  396  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  32.61 
 
 
669 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  35.1 
 
 
658 aa  337  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  36.28 
 
 
635 aa  326  8.000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  38.91 
 
 
533 aa  320  5e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0784  beta-lactamase  35.84 
 
 
638 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  34.62 
 
 
661 aa  304  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  40.36 
 
 
657 aa  286  5.999999999999999e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  33.76 
 
 
633 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  37.12 
 
 
677 aa  283  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  33.97 
 
 
674 aa  273  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  34.24 
 
 
695 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  28.66 
 
 
662 aa  246  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  34.22 
 
 
717 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  30.75 
 
 
637 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4139  beta-lactamase  40.43 
 
 
422 aa  210  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  30.58 
 
 
636 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  30.89 
 
 
601 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  29.53 
 
 
595 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.44 
 
 
559 aa  130  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.3 
 
 
588 aa  130  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  32.97 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  27.13 
 
 
513 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  31.83 
 
 
466 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  27.66 
 
 
513 aa  127  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  28.28 
 
 
539 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  29.62 
 
 
530 aa  125  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  27.66 
 
 
513 aa  124  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  25.83 
 
 
691 aa  124  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  29.01 
 
 
498 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  26.67 
 
 
694 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  28.04 
 
 
600 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  31.4 
 
 
616 aa  121  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  27.13 
 
 
513 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  29.77 
 
 
711 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  32.44 
 
 
460 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  25.87 
 
 
694 aa  118  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  26.19 
 
 
691 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  26.19 
 
 
691 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.3 
 
 
453 aa  117  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  25.98 
 
 
691 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  25.98 
 
 
691 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  25.77 
 
 
691 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  24.34 
 
 
694 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  28.53 
 
 
456 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  28.53 
 
 
681 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  29.04 
 
 
1055 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  28.78 
 
 
610 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  30.09 
 
 
497 aa  112  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3002  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 
630 aa  112  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398528 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  29.23 
 
 
499 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.64 
 
 
484 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.17 
 
 
367 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  25.3 
 
 
485 aa  109  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  28.05 
 
 
580 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  28.61 
 
 
590 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  27.33 
 
 
342 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3823  beta-lactamase  26.93 
 
 
398 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  31.46 
 
 
478 aa  106  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  26.05 
 
 
485 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  28.24 
 
 
513 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  29.22 
 
 
501 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  24.4 
 
 
485 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  23.58 
 
 
485 aa  104  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  26.34 
 
 
447 aa  103  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  24.93 
 
 
514 aa  104  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  26.2 
 
 
405 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  25.45 
 
 
485 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.96 
 
 
480 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  26.61 
 
 
486 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.4 
 
 
485 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  24.11 
 
 
485 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.4 
 
 
485 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  25.29 
 
 
494 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  25.23 
 
 
519 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  29.52 
 
 
451 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  31.94 
 
 
450 aa  101  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  25.84 
 
 
614 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  29.14 
 
 
446 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  27.09 
 
 
437 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  26.19 
 
 
359 aa  100  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  30.12 
 
 
480 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  25.6 
 
 
401 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  27.25 
 
 
496 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  25.99 
 
 
386 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  26.11 
 
 
359 aa  98.6  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  26.8 
 
 
455 aa  98.6  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  27.6 
 
 
398 aa  98.6  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  26.04 
 
 
530 aa  98.6  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  26.86 
 
 
466 aa  98.6  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  23.96 
 
 
485 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  24.11 
 
 
485 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.18 
 
 
413 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  25.15 
 
 
384 aa  97.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  23.39 
 
 
485 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  27.51 
 
 
560 aa  96.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  30.72 
 
 
507 aa  97.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  28.4 
 
 
378 aa  95.9  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  28.88 
 
 
574 aa  95.9  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>