More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3669 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  100 
 
 		 507 aa  1029    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  36.56 
 
 		 580 aa  230  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  36.06 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  35.05 
 
 		 410 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  35.39 
 
 		 410 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  34.12 
 
 		 398 aa  217  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  35.11 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00893  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.86 
 
 		 504 aa  203  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.96 
 
 		 483 aa  191  4e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  34.06 
 
 		 513 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  31.33 
 
 		 513 aa  180  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  33.72 
 
 		 513 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  32.43 
 
 		 513 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  34.29 
 
 		 5698 aa  169  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  31.05 
 
 		 389 aa  166  8e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3450  putative penicillin-binding protein  30.98 
 
 		 345 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1798  putative penicillin-binding protein  30.37 
 
 		 345 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3251  penicillin-binding protein  28.83 
 
 		 374 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3506  penicillin-binding protein  28.83 
 
 		 345 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3457  penicillin-binding protein, putative  28.18 
 
 		 345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0846079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3161  beta-lactamase  28.53 
 
 		 345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3466  putative penicillin-binding protein  28.83 
 
 		 345 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3224  penicillin-binding protein  28.53 
 
 		 374 aa  146  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000147452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3157  beta-lactamase  28.4 
 
 		 345 aa  143  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00126272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  36.12 
 
 		 285 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  31.15 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  31.56 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  27.44 
 
 		 533 aa  121  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  24.48 
 
 		 543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  24.48 
 
 		 543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.6 
 
 		 834 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  23.41 
 
 		 559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  26.82 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  27.56 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  28.03 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  28.69 
 
 		 610 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.5 
 
 		 529 aa  107  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  30.55 
 
 		 695 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  29.3 
 
 		 635 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  28.05 
 
 		 658 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  27.47 
 
 		 600 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  31.58 
 
 		 677 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  28.45 
 
 		 778 aa  100  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  28.08 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  30.46 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  27.84 
 
 		 637 aa  98.6  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  27.01 
 
 		 391 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  29.22 
 
 		 674 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.51 
 
 		 356 aa  97.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  24.21 
 
 		 514 aa  97.1  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  27.78 
 
 		 450 aa  97.1  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  25.81 
 
 		 675 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  27.25 
 
 		 633 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  28.23 
 
 		 460 aa  94  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.17 
 
 		 362 aa  93.6  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  22.95 
 
 		 453 aa  93.6  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  28.08 
 
 		 717 aa  93.2  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.79 
 
 		 477 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  30 
 
 		 681 aa  92.8  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  25.27 
 
 		 520 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  26.39 
 
 		 380 aa  92.8  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  26.21 
 
 		 497 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0784  beta-lactamase  26.48 
 
 		 638 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  23.54 
 
 		 486 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.35 
 
 		 601 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  29.06 
 
 		 650 aa  91.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  27.91 
 
 		 455 aa  91.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  26.32 
 
 		 555 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  21.8 
 
 		 353 aa  90.9  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  30.92 
 
 		 711 aa  90.1  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  28.7 
 
 		 497 aa  90.1  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  25.23 
 
 		 803 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  26.37 
 
 		 385 aa  89  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  24.45 
 
 		 614 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  29.6 
 
 		 381 aa  88.2  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  27.88 
 
 		 657 aa  88.2  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  30.58 
 
 		 507 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  25.8 
 
 		 502 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  29.94 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.25 
 
 		 392 aa  87.8  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  23.46 
 
 		 431 aa  87.8  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  24.51 
 
 		 655 aa  87.4  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.22 
 
 		 539 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  23.38 
 
 		 1032 aa  87  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  23.55 
 
 		 403 aa  87  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  23.49 
 
 		 669 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  26.4 
 
 		 445 aa  86.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  26.9 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.37 
 
 		 484 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  26.52 
 
 		 543 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  27.85 
 
 		 463 aa  86.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  27.41 
 
 		 713 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  28.01 
 
 		 498 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  27.83 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3187  beta-lactamase  27.55 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000216369  hitchhiker  0.000000000911992 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  28.65 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  26.61 
 
 		 526 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.22 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  24.79 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.27 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>