More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2360 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  100 
 
 
494 aa  1007    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  29.45 
 
 
513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  29.86 
 
 
513 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  29.22 
 
 
513 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  29.08 
 
 
513 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  29.67 
 
 
483 aa  128  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  29.8 
 
 
405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  30.47 
 
 
507 aa  121  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00893  putative non-ribosomal peptide synthetase  28.3 
 
 
504 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  32.79 
 
 
285 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  28.79 
 
 
580 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  26.54 
 
 
533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  34.27 
 
 
423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  28.01 
 
 
675 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  29.71 
 
 
410 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  29.81 
 
 
657 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  28.87 
 
 
481 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  28.57 
 
 
410 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  30.43 
 
 
560 aa  106  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  29.66 
 
 
410 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  29.2 
 
 
410 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  28.87 
 
 
490 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  27.32 
 
 
481 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  27.32 
 
 
481 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  27.89 
 
 
463 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  26.8 
 
 
481 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  27.89 
 
 
483 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  26.14 
 
 
365 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  30.12 
 
 
530 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.46 
 
 
487 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  26.63 
 
 
677 aa  100  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.51 
 
 
442 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  26.76 
 
 
480 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  25.38 
 
 
658 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  26.84 
 
 
662 aa  98.2  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  25.23 
 
 
398 aa  97.8  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  30.93 
 
 
450 aa  97.8  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  22.43 
 
 
384 aa  97.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.81 
 
 
505 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  27 
 
 
483 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  25 
 
 
601 aa  94  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  28.36 
 
 
695 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  22.84 
 
 
483 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  27.88 
 
 
397 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  28.17 
 
 
397 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  32.83 
 
 
966 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  26.6 
 
 
476 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  29.72 
 
 
362 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.44 
 
 
559 aa  90.9  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  32.66 
 
 
681 aa  90.5  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  27.82 
 
 
510 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  27.09 
 
 
519 aa  89.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3457  penicillin-binding protein, putative  28.64 
 
 
345 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0846079  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  30.74 
 
 
409 aa  89  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  32.1 
 
 
445 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.63 
 
 
480 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1798  putative penicillin-binding protein  28.57 
 
 
345 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  30.3 
 
 
778 aa  89  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27.73 
 
 
464 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  32.47 
 
 
358 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  27 
 
 
497 aa  88.2  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.79 
 
 
595 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  26.73 
 
 
403 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  27 
 
 
431 aa  87.8  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  29.91 
 
 
610 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  26.18 
 
 
5698 aa  87  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  23.73 
 
 
555 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  35.85 
 
 
478 aa  87.4  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.45 
 
 
669 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  24.77 
 
 
342 aa  86.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  29.9 
 
 
491 aa  86.7  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3161  beta-lactamase  28.43 
 
 
345 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.9 
 
 
508 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  29.84 
 
 
451 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  26.9 
 
 
455 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  31.7 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  27.04 
 
 
717 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  31.56 
 
 
796 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.76 
 
 
453 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  26.97 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  27.36 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  34.84 
 
 
479 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  31.56 
 
 
796 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  25.94 
 
 
600 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  25.21 
 
 
588 aa  85.1  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1817  beta-lactamase  29.91 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  28.02 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  27.18 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.66 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3251  penicillin-binding protein  28.57 
 
 
374 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  28.04 
 
 
511 aa  84  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  31.94 
 
 
441 aa  84  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  29.5 
 
 
636 aa  84  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  25 
 
 
421 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3224  penicillin-binding protein  28.57 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000147452  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  34.4 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  25 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3506  penicillin-binding protein  28.57 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  25.22 
 
 
633 aa  83.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  30.85 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>