More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0294 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  100 
 
 
834 aa  1706    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  33.85 
 
 
681 aa  363  8e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  36.88 
 
 
691 aa  249  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  36.64 
 
 
691 aa  247  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  36.64 
 
 
691 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  36.64 
 
 
691 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  36.41 
 
 
691 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  33.95 
 
 
694 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  38.2 
 
 
694 aa  241  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  38.2 
 
 
694 aa  235  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  35.27 
 
 
691 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  31.27 
 
 
519 aa  228  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  28.51 
 
 
715 aa  177  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  30.07 
 
 
670 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.86 
 
 
480 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.15 
 
 
601 aa  134  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25.88 
 
 
595 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  29.17 
 
 
519 aa  132  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  27.62 
 
 
507 aa  120  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  30.35 
 
 
378 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  27.75 
 
 
363 aa  117  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  28.48 
 
 
356 aa  117  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  31.06 
 
 
529 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  35.22 
 
 
325 aa  115  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  34.86 
 
 
480 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.61 
 
 
559 aa  114  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  29.09 
 
 
525 aa  114  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  29.43 
 
 
370 aa  114  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.77 
 
 
442 aa  114  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  33.68 
 
 
513 aa  114  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  27.45 
 
 
362 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  30.9 
 
 
658 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  26.54 
 
 
403 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  25.6 
 
 
507 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  34.02 
 
 
513 aa  112  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  26.94 
 
 
461 aa  111  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  28.27 
 
 
437 aa  112  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  29.58 
 
 
533 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  32 
 
 
446 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  31.12 
 
 
470 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  30.86 
 
 
342 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  26.07 
 
 
530 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  32.99 
 
 
513 aa  108  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  30.57 
 
 
395 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  33.51 
 
 
285 aa  108  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  28.63 
 
 
369 aa  108  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  28.83 
 
 
677 aa  108  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  30.31 
 
 
361 aa  108  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  28.46 
 
 
445 aa  107  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  27.73 
 
 
537 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  28.37 
 
 
526 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  23.33 
 
 
588 aa  106  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  26.72 
 
 
499 aa  106  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  30.43 
 
 
711 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  24.44 
 
 
453 aa  105  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  32.47 
 
 
513 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  28.49 
 
 
351 aa  104  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.25 
 
 
487 aa  103  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  25 
 
 
547 aa  103  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  28.84 
 
 
848 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  28.57 
 
 
793 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.06 
 
 
508 aa  102  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  28.57 
 
 
476 aa  101  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  30.28 
 
 
391 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  26.09 
 
 
417 aa  102  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  29.31 
 
 
517 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  27.18 
 
 
633 aa  100  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  28.61 
 
 
803 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.03 
 
 
364 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  24.94 
 
 
523 aa  100  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  25 
 
 
466 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  29.85 
 
 
520 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  25.48 
 
 
717 aa  100  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  25.35 
 
 
485 aa  99.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  25.48 
 
 
485 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  26.04 
 
 
419 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  26.69 
 
 
479 aa  100  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  26.53 
 
 
446 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  28.88 
 
 
425 aa  99.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  26.38 
 
 
503 aa  98.6  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  26.18 
 
 
531 aa  98.6  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  27.72 
 
 
422 aa  98.6  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  25.86 
 
 
551 aa  98.2  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  26.72 
 
 
431 aa  98.2  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  24.93 
 
 
485 aa  98.2  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  29.17 
 
 
416 aa  97.8  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  25.21 
 
 
464 aa  97.8  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2275  beta-lactamase  26.17 
 
 
383 aa  97.8  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0956783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.77 
 
 
392 aa  97.8  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  36.47 
 
 
374 aa  97.4  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  25.6 
 
 
450 aa  96.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  25.54 
 
 
330 aa  97.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  28.12 
 
 
476 aa  97.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  25.74 
 
 
662 aa  96.3  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  28 
 
 
447 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  25.33 
 
 
475 aa  96.3  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  28.57 
 
 
338 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.7 
 
 
389 aa  96.3  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  29.57 
 
 
389 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  25.82 
 
 
409 aa  96.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>