More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2068 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  100 
 
 		 385 aa  795    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  66.49 
 
 		 380 aa  537  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  62.87 
 
 		 389 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  60.57 
 
 		 385 aa  502  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  47.55 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  45.21 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  42.08 
 
 		 363 aa  308  9e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3874  beta-lactamase  41.09 
 
 		 359 aa  293  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  38.9 
 
 		 377 aa  281  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  40.63 
 
 		 455 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  37.2 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  40.32 
 
 		 455 aa  250  4e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  37.9 
 
 		 466 aa  243  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  32.85 
 
 		 444 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  31.1 
 
 		 445 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0370  beta-lactamase  31.34 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.405453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  26.26 
 
 		 544 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  26.75 
 
 		 517 aa  133  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  25.5 
 
 		 526 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.73 
 
 		 520 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  27.33 
 
 		 536 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  26.73 
 
 		 566 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  26.79 
 
 		 547 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  24.69 
 
 		 567 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  25.9 
 
 		 803 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  24.69 
 
 		 485 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  27.59 
 
 		 519 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  22.62 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  26.84 
 
 		 530 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  25.55 
 
 		 513 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  26.27 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  27.14 
 
 		 529 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  24.48 
 
 		 531 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  24.74 
 
 		 620 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  29.64 
 
 		 499 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  25.23 
 
 		 497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  22.89 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.47 
 
 		 480 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  23.24 
 
 		 523 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  26.92 
 
 		 485 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  25.28 
 
 		 466 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  23.29 
 
 		 485 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  23.01 
 
 		 531 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  26.38 
 
 		 533 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  22.98 
 
 		 485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  24.62 
 
 		 519 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  27.27 
 
 		 519 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  27.16 
 
 		 531 aa  110  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  24.29 
 
 		 517 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  25.64 
 
 		 566 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  22.98 
 
 		 485 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  26.24 
 
 		 544 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  26.32 
 
 		 550 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  26.73 
 
 		 526 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  24.32 
 
 		 551 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0563  beta-lactamase  26.89 
 
 		 506 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000636485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  24.29 
 
 		 503 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  24.54 
 
 		 603 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  27.57 
 
 		 562 aa  106  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  25.66 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  22.67 
 
 		 485 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  24.77 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  22.05 
 
 		 485 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  22.12 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.57 
 
 		 601 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  21.74 
 
 		 485 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  21.74 
 
 		 485 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  23.44 
 
 		 655 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  26.55 
 
 		 533 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25.9 
 
 		 446 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  23.84 
 
 		 822 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  27.57 
 
 		 362 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  26.9 
 
 		 559 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.15 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  24.18 
 
 		 497 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  23.96 
 
 		 480 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  24.82 
 
 		 533 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  23.6 
 
 		 595 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  24.82 
 
 		 533 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  24.82 
 
 		 533 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  23.08 
 
 		 635 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.82 
 
 		 477 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  25.45 
 
 		 476 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  24.41 
 
 		 463 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  22.36 
 
 		 464 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  24.14 
 
 		 386 aa  93.6  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  24.04 
 
 		 461 aa  92.8  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  25.54 
 
 		 525 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  22.74 
 
 		 455 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  25.85 
 
 		 507 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.81 
 
 		 487 aa  90.9  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  24.72 
 
 		 389 aa  90.1  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  21.83 
 
 		 453 aa  90.5  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  23.56 
 
 		 650 aa  90.1  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  23.81 
 
 		 669 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  23.26 
 
 		 484 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  21.82 
 
 		 591 aa  90.1  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  21.14 
 
 		 530 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  22.89 
 
 		 834 aa  89.7  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3002  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 630 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>