More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3002 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3002  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 630 aa  1306    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  28.74 
 
 		 614 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  28.84 
 
 		 711 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  25.74 
 
 		 616 aa  151  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  30.26 
 
 		 636 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  31.52 
 
 		 677 aa  113  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  26.9 
 
 		 658 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  27.27 
 
 		 650 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.15 
 
 		 601 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.05 
 
 		 533 aa  106  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  26.03 
 
 		 591 aa  104  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  28.96 
 
 		 369 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  24.38 
 
 		 453 aa  103  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.83 
 
 		 669 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  24.8 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  24.8 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  27.69 
 
 		 657 aa  101  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  32.12 
 
 		 695 aa  100  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  24.77 
 
 		 513 aa  99.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  26.01 
 
 		 635 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  29.23 
 
 		 778 aa  98.2  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  26.1 
 
 		 461 aa  97.8  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  23.75 
 
 		 588 aa  97.4  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  31.4 
 
 		 661 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.05 
 
 		 367 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.03 
 
 		 539 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  24.07 
 
 		 513 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  24.38 
 
 		 513 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  26.17 
 
 		 485 aa  94  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  26.78 
 
 		 694 aa  94  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  26.33 
 
 		 485 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  31.53 
 
 		 633 aa  92.8  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  23.46 
 
 		 513 aa  92  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  28.71 
 
 		 547 aa  92  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  27.99 
 
 		 610 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  26.42 
 
 		 559 aa  89.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  24.55 
 
 		 485 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  26.16 
 
 		 603 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  24.33 
 
 		 389 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  25.23 
 
 		 485 aa  89  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  23.14 
 
 		 385 aa  89  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.74 
 
 		 681 aa  88.6  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  23.26 
 
 		 637 aa  88.2  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  25.55 
 
 		 485 aa  88.2  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  25.63 
 
 		 485 aa  87.8  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  25.23 
 
 		 485 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.8 
 
 		 493 aa  87  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  27.4 
 
 		 389 aa  87  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  26.72 
 
 		 694 aa  87  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  25.23 
 
 		 485 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  25.23 
 
 		 485 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  25.74 
 
 		 662 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.56 
 
 		 834 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.75 
 
 		 342 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  26.12 
 
 		 691 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  26.59 
 
 		 566 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  23.5 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  23.81 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  25.16 
 
 		 717 aa  85.1  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  30.52 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  24.55 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  24.79 
 
 		 694 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  21.65 
 
 		 595 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  24.85 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  27.39 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  29.61 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  25.89 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  24.61 
 
 		 485 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  27.23 
 
 		 421 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  24.52 
 
 		 691 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.73 
 
 		 421 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  24.52 
 
 		 691 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  27.23 
 
 		 412 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  24.52 
 
 		 691 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  29.7 
 
 		 580 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  26.73 
 
 		 412 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  26.28 
 
 		 466 aa  83.2  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.29 
 
 		 476 aa  83.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.73 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.11 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  29.19 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  25.81 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  26.73 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  32.83 
 
 		 674 aa  81.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  28.75 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  28.32 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  24.56 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  27.65 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  22.05 
 
 		 490 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  27.17 
 
 		 416 aa  80.5  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  30.49 
 
 		 351 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  22.92 
 
 		 1032 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  24.46 
 
 		 519 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  23.75 
 
 		 691 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.97 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  29.41 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  23.75 
 
 		 691 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  29.78 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4139  beta-lactamase  26.33 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>