More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3068 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  100 
 
 		 466 aa  947    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  76.1 
 
 		 447 aa  674    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  64.8 
 
 		 455 aa  578  1e-164  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  63.47 
 
 		 455 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  40.18 
 
 		 380 aa  260  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  39.3 
 
 		 389 aa  256  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  40.13 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  37.66 
 
 		 426 aa  249  8e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  37.9 
 
 		 385 aa  242  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  38.7 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  36.97 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  34.55 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  38.34 
 
 		 377 aa  217  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3874  beta-lactamase  35.05 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0370  beta-lactamase  35.76 
 
 		 403 aa  199  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.405453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  35.94 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  32.1 
 
 		 803 aa  179  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  30.91 
 
 		 526 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  30.27 
 
 		 513 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  30.16 
 
 		 544 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  33.33 
 
 		 529 aa  167  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  30.49 
 
 		 519 aa  164  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  29.61 
 
 		 520 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  30.07 
 
 		 523 aa  160  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  31.48 
 
 		 567 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  26.55 
 
 		 591 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  27.27 
 
 		 485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  27.72 
 
 		 566 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  31.93 
 
 		 533 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  27.35 
 
 		 485 aa  152  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  27.08 
 
 		 485 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  26.45 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  31.87 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  26.72 
 
 		 485 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  26.45 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  32.43 
 
 		 531 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  27.08 
 
 		 485 aa  147  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  26.65 
 
 		 485 aa  146  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  26.45 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  26.45 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  26.27 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  32.24 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  31.71 
 
 		 519 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  33.14 
 
 		 485 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  27.49 
 
 		 526 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  31.28 
 
 		 530 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  29.11 
 
 		 517 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  31.23 
 
 		 536 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  30.36 
 
 		 547 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  30.69 
 
 		 531 aa  136  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  27.09 
 
 		 620 aa  136  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  29.4 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  29.4 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  29.4 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  30.58 
 
 		 531 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  27 
 
 		 603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  31.37 
 
 		 562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  27.46 
 
 		 497 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  30.32 
 
 		 517 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  29.47 
 
 		 635 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  28.17 
 
 		 543 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  30.41 
 
 		 544 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  25.93 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  28.33 
 
 		 551 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  31.93 
 
 		 550 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  30.29 
 
 		 503 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  28.25 
 
 		 822 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  30.47 
 
 		 566 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  26.67 
 
 		 530 aa  116  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  29.94 
 
 		 507 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  28.61 
 
 		 478 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25 
 
 		 477 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  26.27 
 
 		 466 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.91 
 
 		 539 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  28.9 
 
 		 497 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  29.33 
 
 		 519 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.32 
 
 		 681 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.89 
 
 		 669 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  21.66 
 
 		 505 aa  107  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  24.53 
 
 		 498 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  24.53 
 
 		 498 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.9 
 
 		 559 aa  106  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  28.39 
 
 		 455 aa  106  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  25.42 
 
 		 1032 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  25.94 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.93 
 
 		 601 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  25.53 
 
 		 480 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  30 
 
 		 674 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  25.33 
 
 		 524 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25 
 
 		 834 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.69 
 
 		 480 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.61 
 
 		 484 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  25.21 
 
 		 359 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  24.77 
 
 		 543 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  25.16 
 
 		 446 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  24.77 
 
 		 543 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  27.61 
 
 		 711 aa  99.8  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0563  beta-lactamase  27.78 
 
 		 506 aa  99.8  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000636485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  24.46 
 
 		 578 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  23.33 
 
 		 533 aa  99.4  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>