More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4420 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  100 
 
 		 519 aa  1036    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  97.5 
 
 		 519 aa  1012    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  47.65 
 
 		 530 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  44.6 
 
 		 544 aa  361  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  45.81 
 
 		 566 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  42.34 
 
 		 533 aa  350  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  40.53 
 
 		 533 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  41.43 
 
 		 536 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  41.07 
 
 		 562 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  41.7 
 
 		 531 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  42.06 
 
 		 550 aa  319  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  40.24 
 
 		 531 aa  315  9e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  42.24 
 
 		 485 aa  315  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  42.32 
 
 		 531 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  38.91 
 
 		 551 aa  306  7e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  40.29 
 
 		 533 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  40.29 
 
 		 533 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  40.29 
 
 		 533 aa  296  9e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  42.09 
 
 		 519 aa  289  7e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  37.37 
 
 		 503 aa  288  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  34.14 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  34.38 
 
 		 513 aa  226  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  30.41 
 
 		 517 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  34.4 
 
 		 499 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  27.63 
 
 		 497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  27.89 
 
 		 523 aa  178  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  28.16 
 
 		 803 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  27.94 
 
 		 519 aa  173  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  27.15 
 
 		 526 aa  173  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  27.35 
 
 		 544 aa  167  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  23.4 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  26.15 
 
 		 529 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  26.76 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  26.76 
 
 		 485 aa  160  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  27.4 
 
 		 485 aa  160  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  26.98 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  26.03 
 
 		 526 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  26.98 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  26.98 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  26.76 
 
 		 485 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  29.27 
 
 		 567 aa  157  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  26.71 
 
 		 485 aa  157  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  26.76 
 
 		 485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  31.13 
 
 		 547 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  28.15 
 
 		 566 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  30.79 
 
 		 455 aa  150  7e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  30.79 
 
 		 455 aa  149  8e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  32.78 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  27.57 
 
 		 603 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  25.84 
 
 		 485 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  26.16 
 
 		 485 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  31.95 
 
 		 466 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  29.18 
 
 		 655 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  31.76 
 
 		 517 aa  133  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  23.2 
 
 		 591 aa  131  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  26.74 
 
 		 380 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  25.23 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  27.59 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  26.46 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.4 
 
 		 505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  29.82 
 
 		 822 aa  114  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  23.51 
 
 		 389 aa  110  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  25.98 
 
 		 377 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.77 
 
 		 356 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  30.81 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  25.47 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  29.64 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.08 
 
 		 595 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  29.26 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  25.59 
 
 		 588 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  23.9 
 
 		 514 aa  100  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  29.47 
 
 		 461 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  31.15 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.09 
 
 		 539 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  26.67 
 
 		 466 aa  98.2  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  29.19 
 
 		 498 aa  97.8  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  25.29 
 
 		 601 aa  97.1  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  27.78 
 
 		 620 aa  96.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  24.52 
 
 		 1032 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  22.03 
 
 		 1055 aa  95.9  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2174  beta-lactamase  22.8 
 
 		 429 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0563  beta-lactamase  27.03 
 
 		 506 aa  93.6  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000636485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  29.15 
 
 		 456 aa  93.2  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2236  beta-lactamase  23.26 
 
 		 428 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  28.43 
 
 		 378 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  26.8 
 
 		 524 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  27.41 
 
 		 477 aa  90.9  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  25.85 
 
 		 600 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  24.28 
 
 		 395 aa  90.1  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  28.7 
 
 		 460 aa  90.1  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  27 
 
 		 633 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  29.36 
 
 		 530 aa  89.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.74 
 
 		 681 aa  89.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  27.33 
 
 		 533 aa  89  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  23.98 
 
 		 691 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  21.84 
 
 		 353 aa  87.8  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  27.09 
 
 		 462 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  25.5 
 
 		 384 aa  87.8  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  28.14 
 
 		 436 aa  87  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  29.97 
 
 		 437 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>