More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4810 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  99.81 
 
 
533 aa  1072    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  99.81 
 
 
533 aa  1072    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  69.71 
 
 
531 aa  723    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  100 
 
 
533 aa  1074    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  68.06 
 
 
531 aa  717    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  60.34 
 
 
562 aa  622  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  55.72 
 
 
551 aa  575  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  54.97 
 
 
533 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  52.35 
 
 
533 aa  514  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  54.24 
 
 
485 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  53.02 
 
 
531 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  50.6 
 
 
536 aa  458  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  52.01 
 
 
519 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  48.86 
 
 
566 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  46.71 
 
 
530 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  41.73 
 
 
544 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  45 
 
 
550 aa  359  7e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  40.67 
 
 
519 aa  316  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  39.75 
 
 
519 aa  307  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  37.41 
 
 
503 aa  246  8e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  36.49 
 
 
455 aa  240  5e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  31.44 
 
 
513 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  29.4 
 
 
803 aa  189  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  29.36 
 
 
526 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  31.18 
 
 
519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  27.79 
 
 
485 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  27.13 
 
 
485 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  27.36 
 
 
485 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  30.39 
 
 
523 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  27.76 
 
 
485 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  27.65 
 
 
485 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  27.76 
 
 
485 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  27.96 
 
 
485 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  27.96 
 
 
485 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  27.13 
 
 
485 aa  169  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  30.14 
 
 
499 aa  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  26.65 
 
 
485 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  28.21 
 
 
544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  26.73 
 
 
485 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  31.46 
 
 
567 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  27.19 
 
 
526 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  28.54 
 
 
497 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  31.36 
 
 
447 aa  153  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  26.96 
 
 
517 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  29.45 
 
 
529 aa  151  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  24.49 
 
 
591 aa  143  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  28.43 
 
 
655 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  29.4 
 
 
466 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  28.03 
 
 
455 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  27.78 
 
 
455 aa  137  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  28.34 
 
 
547 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  25.87 
 
 
520 aa  134  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  26.53 
 
 
566 aa  131  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  30.79 
 
 
620 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  31.1 
 
 
461 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  28.12 
 
 
517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  29.69 
 
 
539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  27.16 
 
 
380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  25.81 
 
 
603 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  28.47 
 
 
717 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  27.01 
 
 
426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.43 
 
 
595 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.81 
 
 
601 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  28.01 
 
 
822 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  30.06 
 
 
464 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  28.24 
 
 
498 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  28.65 
 
 
356 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  28 
 
 
445 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  27.23 
 
 
537 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2174  beta-lactamase  25.26 
 
 
429 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  28.53 
 
 
444 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2236  beta-lactamase  25.65 
 
 
428 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  24.82 
 
 
385 aa  104  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  27.04 
 
 
530 aa  103  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  29.5 
 
 
437 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  24.8 
 
 
501 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  25.56 
 
 
588 aa  100  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  24.6 
 
 
389 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.74 
 
 
401 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  24.92 
 
 
481 aa  98.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.84 
 
 
551 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  30.28 
 
 
533 aa  97.8  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  28.28 
 
 
966 aa  97.1  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  24.59 
 
 
481 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  24.59 
 
 
463 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  22.94 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  24.59 
 
 
481 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.11 
 
 
480 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  24.54 
 
 
669 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  25.06 
 
 
600 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  23.53 
 
 
481 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  24.44 
 
 
524 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  25.27 
 
 
399 aa  94  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  27.38 
 
 
330 aa  94  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  26.92 
 
 
530 aa  93.6  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  27.82 
 
 
431 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  24.01 
 
 
483 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  27.38 
 
 
543 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  26.69 
 
 
462 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.09 
 
 
484 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>