More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1298 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  100 
 
 
566 aa  1168    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  41.47 
 
 
485 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  40.41 
 
 
485 aa  346  6e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  40.27 
 
 
485 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  40.23 
 
 
485 aa  343  7e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  36.48 
 
 
567 aa  342  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  40.23 
 
 
485 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  40 
 
 
485 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  39.77 
 
 
485 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  40 
 
 
485 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  40 
 
 
485 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  40.05 
 
 
485 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  38.41 
 
 
485 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  31.73 
 
 
591 aa  289  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  30.23 
 
 
603 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  29.89 
 
 
517 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  31.06 
 
 
513 aa  230  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  32.97 
 
 
803 aa  226  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  30.91 
 
 
523 aa  224  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  31.63 
 
 
526 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  30.43 
 
 
519 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  26.95 
 
 
497 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  32.74 
 
 
547 aa  199  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  27.68 
 
 
520 aa  192  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  34.5 
 
 
822 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  28.37 
 
 
526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  28.64 
 
 
544 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  27.35 
 
 
529 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  29 
 
 
447 aa  169  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  28.76 
 
 
455 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  28.76 
 
 
455 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  29.43 
 
 
503 aa  156  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  27.72 
 
 
466 aa  154  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  27.64 
 
 
519 aa  151  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  28.15 
 
 
519 aa  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  30.77 
 
 
566 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  26.24 
 
 
499 aa  147  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  29.17 
 
 
620 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  27.93 
 
 
544 aa  140  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  28.47 
 
 
533 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  26.78 
 
 
531 aa  137  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  27.1 
 
 
531 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  27.88 
 
 
550 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  28.33 
 
 
485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  26.82 
 
 
551 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  27.9 
 
 
426 aa  135  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  28.38 
 
 
453 aa  134  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  26.94 
 
 
562 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  26.12 
 
 
531 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  27.11 
 
 
533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  26.73 
 
 
385 aa  127  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  27.2 
 
 
530 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  29.41 
 
 
517 aa  125  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  26.78 
 
 
455 aa  124  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  26.05 
 
 
536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  25.93 
 
 
533 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  26.56 
 
 
385 aa  121  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  25.93 
 
 
533 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  25.93 
 
 
533 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  27.44 
 
 
519 aa  121  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.38 
 
 
487 aa  121  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  27.87 
 
 
1055 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  28.53 
 
 
1032 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  25.15 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  23.81 
 
 
380 aa  118  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  28.7 
 
 
437 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.7 
 
 
480 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  27.12 
 
 
533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  26.11 
 
 
401 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  26.16 
 
 
655 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  26.1 
 
 
377 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  27.66 
 
 
505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  26.22 
 
 
466 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  27.01 
 
 
486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  27.43 
 
 
461 aa  112  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  29.54 
 
 
539 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  31.72 
 
 
345 aa  110  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  24.23 
 
 
498 aa  110  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  24.23 
 
 
498 aa  110  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.83 
 
 
498 aa  109  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  26.39 
 
 
514 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  23.15 
 
 
399 aa  106  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.41 
 
 
477 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.68 
 
 
453 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.12 
 
 
442 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  27.87 
 
 
478 aa  104  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  26.38 
 
 
588 aa  104  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  25.55 
 
 
464 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  26.18 
 
 
498 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  28.48 
 
 
463 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.28 
 
 
342 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  25.89 
 
 
490 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.46 
 
 
601 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  28.3 
 
 
369 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  25.66 
 
 
537 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  28.1 
 
 
440 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.28 
 
 
377 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  23.08 
 
 
462 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  28.99 
 
 
476 aa  98.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2775  beta-lactamase  28.65 
 
 
472 aa  97.8  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.987091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>