More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4133 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  100 
 
 
822 aa  1649    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  34.1 
 
 
485 aa  231  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  33.91 
 
 
485 aa  227  8e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  33.62 
 
 
485 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  33.62 
 
 
485 aa  220  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  33.33 
 
 
485 aa  220  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  32.66 
 
 
485 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  32.76 
 
 
485 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  33.33 
 
 
485 aa  218  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  33.33 
 
 
485 aa  218  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  32.95 
 
 
485 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  30.72 
 
 
591 aa  216  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  31.14 
 
 
485 aa  212  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  34.47 
 
 
566 aa  194  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  33.43 
 
 
513 aa  189  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  28.06 
 
 
603 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  29.53 
 
 
544 aa  170  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  33.06 
 
 
523 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  31.02 
 
 
526 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  33.81 
 
 
620 aa  157  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  29.23 
 
 
497 aa  154  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  30.35 
 
 
567 aa  153  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  29.15 
 
 
517 aa  150  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  29.7 
 
 
529 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  27.06 
 
 
499 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  32.53 
 
 
547 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  28.83 
 
 
530 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  28.37 
 
 
526 aa  137  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  30.14 
 
 
503 aa  138  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  27.76 
 
 
455 aa  137  9e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  27.52 
 
 
455 aa  136  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  31.17 
 
 
550 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25.05 
 
 
595 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  28.66 
 
 
437 aa  134  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  28.46 
 
 
519 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  27.59 
 
 
803 aa  132  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  32.23 
 
 
544 aa  130  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  27.86 
 
 
531 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27.65 
 
 
453 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  28.65 
 
 
520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  28.5 
 
 
655 aa  129  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  31.61 
 
 
455 aa  129  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  28.37 
 
 
466 aa  128  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  31.98 
 
 
478 aa  128  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  26.65 
 
 
600 aa  127  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  28.3 
 
 
466 aa  126  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  28.76 
 
 
447 aa  126  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  29.82 
 
 
519 aa  126  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  28.78 
 
 
530 aa  124  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  29.82 
 
 
519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  33.23 
 
 
566 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  28.44 
 
 
517 aa  121  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  25.52 
 
 
588 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  29.04 
 
 
531 aa  121  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  24.87 
 
 
426 aa  118  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.71 
 
 
601 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  27.19 
 
 
401 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  29.13 
 
 
551 aa  117  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  29.73 
 
 
533 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  26.16 
 
 
486 aa  117  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  29.73 
 
 
533 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  29.78 
 
 
533 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  26.21 
 
 
498 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  29.79 
 
 
485 aa  114  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  24.7 
 
 
342 aa  114  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  26.14 
 
 
498 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  24.65 
 
 
380 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27.21 
 
 
464 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.71 
 
 
505 aa  109  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  25.28 
 
 
533 aa  109  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  22.16 
 
 
559 aa  108  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  25.36 
 
 
377 aa  108  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  23.94 
 
 
1032 aa  107  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  23.84 
 
 
385 aa  107  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  24.07 
 
 
616 aa  107  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  25.9 
 
 
524 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  29.24 
 
 
531 aa  105  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  24.27 
 
 
669 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  27.1 
 
 
450 aa  104  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  23.73 
 
 
399 aa  103  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  23.16 
 
 
389 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0370  beta-lactamase  28.75 
 
 
403 aa  103  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.405453  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  27.09 
 
 
513 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  26.67 
 
 
444 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  25.59 
 
 
1055 aa  102  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.93 
 
 
477 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  27.85 
 
 
560 aa  102  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.47 
 
 
487 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  24.56 
 
 
385 aa  102  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  24.44 
 
 
514 aa  101  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  27.2 
 
 
533 aa  101  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  24.93 
 
 
498 aa  100  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  24.93 
 
 
498 aa  100  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  25.32 
 
 
482 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  26.25 
 
 
494 aa  99  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  25 
 
 
482 aa  98.6  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1501  beta-lactamase  26.76 
 
 
447 aa  98.6  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130484  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  26.27 
 
 
637 aa  98.6  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  28.54 
 
 
536 aa  98.6  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  26.11 
 
 
533 aa  98.2  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>