More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2813 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  100 
 
 
499 aa  1018    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  36.52 
 
 
530 aa  220  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  29.98 
 
 
497 aa  213  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  29.88 
 
 
513 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  35.08 
 
 
503 aa  204  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  31.05 
 
 
517 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  28.8 
 
 
523 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  29.03 
 
 
803 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  30.09 
 
 
526 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.46 
 
 
529 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  34.4 
 
 
519 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  29.3 
 
 
567 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  32.67 
 
 
544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  27.52 
 
 
485 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  27.8 
 
 
519 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  29.85 
 
 
551 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  27.42 
 
 
485 aa  183  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  34.4 
 
 
519 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  30.44 
 
 
603 aa  179  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  27.36 
 
 
485 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  31.83 
 
 
455 aa  179  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  31.78 
 
 
544 aa  179  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  29.48 
 
 
536 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  27.54 
 
 
485 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  36.84 
 
 
566 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  27.82 
 
 
562 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  26.38 
 
 
485 aa  170  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  26.63 
 
 
485 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  30.44 
 
 
547 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  26.38 
 
 
485 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  26.38 
 
 
485 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  25.91 
 
 
485 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  26.38 
 
 
485 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  26.63 
 
 
485 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  27.87 
 
 
533 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  31.81 
 
 
531 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  34.37 
 
 
550 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  27.25 
 
 
526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  29.29 
 
 
533 aa  163  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  31.7 
 
 
531 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  27.56 
 
 
520 aa  153  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  28.02 
 
 
591 aa  153  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  31.47 
 
 
533 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  28.66 
 
 
519 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  31.47 
 
 
533 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  31.47 
 
 
533 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  29.77 
 
 
531 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  26.24 
 
 
566 aa  147  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  31.64 
 
 
485 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  28.73 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.85 
 
 
533 aa  131  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  24.88 
 
 
455 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  24.88 
 
 
455 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  28.7 
 
 
822 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  30.56 
 
 
620 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  26.12 
 
 
466 aa  123  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  29.67 
 
 
498 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  27.78 
 
 
380 aa  120  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  29.53 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.89 
 
 
559 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  25.34 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  30.75 
 
 
517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  27.04 
 
 
385 aa  117  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  29.92 
 
 
717 aa  117  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  29.64 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  25.82 
 
 
453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  30.86 
 
 
655 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  23.8 
 
 
426 aa  113  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  28.21 
 
 
637 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  28.69 
 
 
662 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  29.23 
 
 
650 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  29.21 
 
 
464 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  26.74 
 
 
466 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.11 
 
 
539 aa  107  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  26.88 
 
 
481 aa  106  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.72 
 
 
834 aa  106  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  26.39 
 
 
486 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  31.07 
 
 
530 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  28.05 
 
 
616 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  25.07 
 
 
389 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  26.52 
 
 
490 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.63 
 
 
487 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.39 
 
 
505 aa  103  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  27.05 
 
 
530 aa  103  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  28.57 
 
 
437 aa  103  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  27.48 
 
 
463 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  29.16 
 
 
401 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  25.26 
 
 
498 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  25.26 
 
 
498 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  25.45 
 
 
481 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  25.81 
 
 
481 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27 
 
 
551 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  25.45 
 
 
481 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  26 
 
 
462 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  29.58 
 
 
426 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  24.34 
 
 
595 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  27.37 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  29.17 
 
 
477 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  25.45 
 
 
483 aa  99  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.36 
 
 
681 aa  99  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>