More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09923 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  100 
 
 		 591 aa  1209    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  42.05 
 
 		 603 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  35.86 
 
 		 485 aa  310  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  34.91 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  35.73 
 
 		 485 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  34.91 
 
 		 485 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  34.7 
 
 		 485 aa  301  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  34.7 
 
 		 485 aa  299  8e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  34.7 
 
 		 485 aa  299  8e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  34.5 
 
 		 485 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  34.7 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  31.73 
 
 		 566 aa  289  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  33.74 
 
 		 485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  33.19 
 
 		 485 aa  282  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  27.1 
 
 		 567 aa  258  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  30.51 
 
 		 513 aa  226  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  29.82 
 
 		 526 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  31.57 
 
 		 520 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  30.72 
 
 		 822 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  27.56 
 
 		 517 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  27.1 
 
 		 497 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  28.42 
 
 		 803 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  25 
 
 		 529 aa  180  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  26.46 
 
 		 544 aa  177  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  24.48 
 
 		 519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  27.01 
 
 		 526 aa  173  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  25.15 
 
 		 523 aa  171  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  25.9 
 
 		 530 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  28.82 
 
 		 455 aa  160  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  26.62 
 
 		 551 aa  158  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  26.55 
 
 		 466 aa  156  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  24.75 
 
 		 547 aa  153  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  28.02 
 
 		 499 aa  153  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  25.93 
 
 		 531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  27.32 
 
 		 447 aa  148  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  25.37 
 
 		 503 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  26.37 
 
 		 533 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  25.74 
 
 		 455 aa  144  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  27.74 
 
 		 620 aa  144  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  25.74 
 
 		 455 aa  144  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  24.82 
 
 		 519 aa  143  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  25.68 
 
 		 533 aa  143  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  25.51 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  25.73 
 
 		 544 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  25.06 
 
 		 531 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  27.05 
 
 		 486 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  26.85 
 
 		 485 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  24.49 
 
 		 533 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  24.49 
 
 		 533 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  24.49 
 
 		 533 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  25.67 
 
 		 562 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  23.2 
 
 		 519 aa  131  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  25.22 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  21.46 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  23.82 
 
 		 377 aa  125  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  25.05 
 
 		 550 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  23.86 
 
 		 566 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  25.74 
 
 		 399 aa  123  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  22.51 
 
 		 519 aa  120  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  24.88 
 
 		 536 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  28.02 
 
 		 1032 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  26.22 
 
 		 655 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.32 
 
 		 342 aa  117  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.82 
 
 		 505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  23.33 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.7 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  26.98 
 
 		 498 aa  114  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  23.55 
 
 		 466 aa  114  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  26.98 
 
 		 498 aa  114  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  24.52 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  24.08 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  25.14 
 
 		 444 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  23.27 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  24.14 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  24.61 
 
 		 470 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  24.19 
 
 		 380 aa  108  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.69 
 
 		 514 aa  108  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.77 
 
 		 1055 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  22.05 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3002  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 630 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  23.25 
 
 		 537 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.28 
 
 		 487 aa  104  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  22.44 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.15 
 
 		 559 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  24.41 
 
 		 610 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25.07 
 
 		 578 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  24.44 
 
 		 325 aa  100  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  22.02 
 
 		 498 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  26.17 
 
 		 450 aa  98.2  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.24 
 
 		 601 aa  97.8  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  23.68 
 
 		 401 aa  97.1  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  24.21 
 
 		 600 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  23.92 
 
 		 616 aa  97.1  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  25.84 
 
 		 533 aa  97.1  9e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  26.21 
 
 		 482 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.88 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.89 
 
 		 442 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  26.21 
 
 		 482 aa  95.9  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.08 
 
 		 362 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  26.63 
 
 		 412 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>