More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0467 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  100 
 
 		 520 aa  1069    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  51.29 
 
 		 526 aa  525  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  37.67 
 
 		 519 aa  353  4e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  37.84 
 
 		 529 aa  348  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  37.52 
 
 		 513 aa  343  5.999999999999999e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  34.81 
 
 		 544 aa  340  4e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  37.57 
 
 		 526 aa  313  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  33.07 
 
 		 523 aa  288  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  34.14 
 
 		 803 aa  279  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  32.31 
 
 		 547 aa  256  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  32.26 
 
 		 517 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  27.25 
 
 		 485 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  31.57 
 
 		 591 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  27.79 
 
 		 485 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  26.56 
 
 		 485 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  30.51 
 
 		 497 aa  207  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  30.02 
 
 		 485 aa  206  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  26.43 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  28.6 
 
 		 517 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  26.53 
 
 		 485 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  26.6 
 
 		 485 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  26.6 
 
 		 485 aa  200  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  26.6 
 
 		 485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  26.32 
 
 		 485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  26.6 
 
 		 485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  27.68 
 
 		 566 aa  192  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  28.57 
 
 		 567 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  29.94 
 
 		 603 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  23.4 
 
 		 519 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  27.35 
 
 		 544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  27.35 
 
 		 530 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  29.61 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  23.51 
 
 		 519 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  30.59 
 
 		 503 aa  159  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  30.96 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  29.21 
 
 		 455 aa  156  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  30.17 
 
 		 447 aa  156  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  29.38 
 
 		 455 aa  156  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  28.08 
 
 		 455 aa  154  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  27.56 
 
 		 499 aa  153  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  28.08 
 
 		 533 aa  150  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  27.46 
 
 		 531 aa  149  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  24.69 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  27.95 
 
 		 533 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  28.15 
 
 		 426 aa  141  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  30.38 
 
 		 1055 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  29.49 
 
 		 566 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  29.22 
 
 		 550 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  25.06 
 
 		 531 aa  133  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  24.71 
 
 		 531 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  25.06 
 
 		 399 aa  133  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  24.66 
 
 		 620 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.67 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  27.17 
 
 		 389 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  26.73 
 
 		 385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  25.12 
 
 		 519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  27.22 
 
 		 385 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  30.89 
 
 		 559 aa  128  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  28.53 
 
 		 505 aa  126  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  27.62 
 
 		 356 aa  126  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  26.32 
 
 		 380 aa  124  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  23.59 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.21 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  25.52 
 
 		 533 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  25.52 
 
 		 533 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  25.52 
 
 		 533 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  29.83 
 
 		 543 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.95 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.62 
 
 		 446 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.53 
 
 		 487 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.54 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  27.25 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  27.25 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  26.95 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  28.49 
 
 		 539 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.42 
 
 		 578 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  28.65 
 
 		 822 aa  116  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  26.04 
 
 		 562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  26.82 
 
 		 524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  24.72 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  27.42 
 
 		 498 aa  114  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  27.42 
 
 		 498 aa  114  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  27.22 
 
 		 848 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  27.78 
 
 		 475 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  25.27 
 
 		 470 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  26.67 
 
 		 353 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  28.24 
 
 		 669 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  26.72 
 
 		 497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  29.49 
 
 		 662 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  28.08 
 
 		 342 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.01 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.57 
 
 		 442 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.37 
 
 		 480 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  26.52 
 
 		 1032 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.42 
 
 		 367 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  27.94 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  29.54 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  29.54 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  29.54 
 
 		 481 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  26.61 
 
 		 658 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>