More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8154 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  100 
 
 		 550 aa  1105    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  61.41 
 
 		 566 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  51.62 
 
 		 544 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  47.71 
 
 		 530 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  44.95 
 
 		 531 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  41.67 
 
 		 562 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  43.28 
 
 		 531 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  44.58 
 
 		 533 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  44.58 
 
 		 533 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  44.58 
 
 		 533 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  44.58 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  43.86 
 
 		 533 aa  369  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  42.17 
 
 		 551 aa  350  5e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  42.13 
 
 		 519 aa  349  7e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  41.92 
 
 		 519 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  42.35 
 
 		 531 aa  340  5e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  39.81 
 
 		 536 aa  333  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  40.68 
 
 		 533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  40.36 
 
 		 519 aa  327  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  35.17 
 
 		 503 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  36.64 
 
 		 455 aa  259  7e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  30.93 
 
 		 513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  31.73 
 
 		 499 aa  194  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  31.4 
 
 		 526 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  29.52 
 
 		 523 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  30.28 
 
 		 519 aa  186  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  29.85 
 
 		 803 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  31.16 
 
 		 544 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  29.81 
 
 		 529 aa  177  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  26.12 
 
 		 485 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  26.12 
 
 		 485 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  26.12 
 
 		 485 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  26.12 
 
 		 485 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  32.05 
 
 		 567 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  26.29 
 
 		 485 aa  171  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  26.13 
 
 		 485 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  25.45 
 
 		 485 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  26.13 
 
 		 485 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  25.68 
 
 		 485 aa  167  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  26.17 
 
 		 485 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  27.14 
 
 		 497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  24.61 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  26.75 
 
 		 566 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  27.12 
 
 		 526 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.35 
 
 		 520 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  24.95 
 
 		 591 aa  147  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  26.79 
 
 		 517 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  29.4 
 
 		 547 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  27.44 
 
 		 655 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  30.23 
 
 		 822 aa  137  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  31.95 
 
 		 447 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  31.18 
 
 		 466 aa  134  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  26.99 
 
 		 603 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  27.18 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.33 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  27.18 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  27.35 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  27.9 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  26.87 
 
 		 389 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  29.91 
 
 		 517 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  26.78 
 
 		 385 aa  120  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  29.7 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  30.28 
 
 		 498 aa  115  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  26.56 
 
 		 385 aa  114  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  28.68 
 
 		 356 aa  113  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  26.76 
 
 		 466 aa  113  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  25.87 
 
 		 620 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.35 
 
 		 601 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  25.05 
 
 		 464 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  30.08 
 
 		 444 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  27.66 
 
 		 717 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  26.12 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  25.94 
 
 		 539 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  27.48 
 
 		 793 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  23.88 
 
 		 498 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  23.88 
 
 		 498 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  28.77 
 
 		 461 aa  99.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  28.06 
 
 		 445 aa  96.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  24.07 
 
 		 588 aa  95.1  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  24.08 
 
 		 834 aa  94  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  24.23 
 
 		 669 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.04 
 
 		 342 aa  93.6  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.11 
 
 		 477 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  24.71 
 
 		 595 aa  91.3  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  24.11 
 
 		 481 aa  91.3  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  24.65 
 
 		 481 aa  90.1  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  24.65 
 
 		 481 aa  90.1  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  23.72 
 
 		 483 aa  90.1  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2174  beta-lactamase  23.85 
 
 		 429 aa  90.1  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2236  beta-lactamase  23.85 
 
 		 428 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0370  beta-lactamase  27.34 
 
 		 403 aa  89.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.405453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  22.91 
 
 		 486 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  23.69 
 
 		 490 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  23.84 
 
 		 463 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  28.29 
 
 		 363 aa  88.2  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  23.84 
 
 		 481 aa  87  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  24.02 
 
 		 501 aa  86.7  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  25.52 
 
 		 475 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  21.26 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>