More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0693 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  100 
 
 
530 aa  1082    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  53.1 
 
 
566 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  47.65 
 
 
519 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  47.03 
 
 
519 aa  455  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  47.84 
 
 
485 aa  428  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  49.79 
 
 
550 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  46.26 
 
 
562 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  46.8 
 
 
544 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  47.82 
 
 
533 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  46.05 
 
 
531 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  43.07 
 
 
551 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  47.71 
 
 
533 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  47.71 
 
 
533 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  47.71 
 
 
533 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  45.95 
 
 
531 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  45.17 
 
 
533 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  46.49 
 
 
531 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  42.83 
 
 
536 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  41.73 
 
 
519 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  37.28 
 
 
503 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  38.72 
 
 
455 aa  299  8e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  32.63 
 
 
499 aa  234  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  32.17 
 
 
513 aa  230  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  30.71 
 
 
544 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  31.67 
 
 
526 aa  213  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  30.29 
 
 
519 aa  200  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  29.83 
 
 
523 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  29.61 
 
 
529 aa  196  9e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  28.33 
 
 
517 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  29.21 
 
 
803 aa  192  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  28.07 
 
 
497 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  27.25 
 
 
526 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  31.82 
 
 
567 aa  179  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  25.9 
 
 
591 aa  177  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  33.1 
 
 
547 aa  177  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  27.35 
 
 
520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  24.61 
 
 
485 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  24.67 
 
 
485 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  25.28 
 
 
485 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  26.23 
 
 
485 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  25.29 
 
 
485 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  24.61 
 
 
485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.61 
 
 
485 aa  163  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  24.61 
 
 
485 aa  163  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.61 
 
 
485 aa  163  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  24.61 
 
 
485 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  25.99 
 
 
485 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  27.85 
 
 
603 aa  156  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  28.54 
 
 
455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  28.54 
 
 
455 aa  154  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  31.3 
 
 
447 aa  151  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  31.61 
 
 
517 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  31.28 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  29.41 
 
 
380 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  30.29 
 
 
822 aa  136  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  25.57 
 
 
655 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  29.4 
 
 
601 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  28.11 
 
 
385 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  28.06 
 
 
426 aa  128  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  27.2 
 
 
566 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  30 
 
 
444 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  25.36 
 
 
389 aa  124  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  30.27 
 
 
377 aa  124  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.46 
 
 
539 aa  123  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  26.84 
 
 
385 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  26.1 
 
 
620 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.66 
 
 
595 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27 
 
 
464 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  30.6 
 
 
461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  27.91 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  29.45 
 
 
530 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  28.44 
 
 
356 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.19 
 
 
551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  29.58 
 
 
717 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.44 
 
 
588 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.27 
 
 
477 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  29.54 
 
 
635 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.14 
 
 
498 aa  106  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  24.04 
 
 
453 aa  105  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.43 
 
 
401 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.58 
 
 
480 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  29.65 
 
 
364 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  25.38 
 
 
778 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  26.86 
 
 
475 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  24.49 
 
 
353 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.23 
 
 
559 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2236  beta-lactamase  23.54 
 
 
428 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2174  beta-lactamase  23.54 
 
 
429 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  28.84 
 
 
445 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  27.76 
 
 
633 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  25.48 
 
 
533 aa  101  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.27 
 
 
681 aa  100  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  24.94 
 
 
669 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.36 
 
 
505 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  27.78 
 
 
436 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  23.78 
 
 
462 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  28.19 
 
 
796 aa  98.2  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  26.97 
 
 
525 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  28.19 
 
 
796 aa  98.2  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.29 
 
 
342 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>