More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0675 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  100 
 
 		 377 aa  773    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  40.27 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  38.99 
 
 		 389 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  38.9 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  39.09 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  37.76 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  35.17 
 
 		 426 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  37.89 
 
 		 455 aa  226  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  37.89 
 
 		 455 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  36.42 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  38.34 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3874  beta-lactamase  34.78 
 
 		 359 aa  216  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  38.18 
 
 		 447 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  34.44 
 
 		 445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0370  beta-lactamase  33.81 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.405453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  35.14 
 
 		 444 aa  176  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.37 
 
 		 544 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  29.15 
 
 		 517 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  23.82 
 
 		 591 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  23.59 
 
 		 520 aa  122  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  26.39 
 
 		 497 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  28.3 
 
 		 567 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  26.54 
 
 		 547 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  25.34 
 
 		 499 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  29.64 
 
 		 530 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.6 
 
 		 513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  22.16 
 
 		 485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  25.95 
 
 		 526 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  26.1 
 
 		 566 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  25.37 
 
 		 517 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  23.9 
 
 		 485 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  24.46 
 
 		 485 aa  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  25.48 
 
 		 803 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  22.26 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  29.79 
 
 		 533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  22.55 
 
 		 485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  23.15 
 
 		 485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  23.15 
 
 		 485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  22.85 
 
 		 485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  22.85 
 
 		 485 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  24.47 
 
 		 523 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  25.98 
 
 		 519 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  24.18 
 
 		 503 aa  110  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  26.01 
 
 		 526 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  22.55 
 
 		 485 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  25.79 
 
 		 620 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  25.82 
 
 		 529 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  28.17 
 
 		 536 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  25.44 
 
 		 530 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  27.56 
 
 		 507 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  25.87 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  22.78 
 
 		 485 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  24.59 
 
 		 519 aa  106  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  25.98 
 
 		 519 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  24.78 
 
 		 480 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  27.11 
 
 		 531 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.41 
 
 		 505 aa  102  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  26.35 
 
 		 497 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  28.75 
 
 		 550 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  24.2 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  27.35 
 
 		 560 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  22.69 
 
 		 498 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  22.69 
 
 		 498 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  25.08 
 
 		 480 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  23.7 
 
 		 514 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  25.68 
 
 		 362 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  24.51 
 
 		 486 aa  97.4  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.13 
 
 		 442 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  27.61 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  28.25 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  27.3 
 
 		 566 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  24.5 
 
 		 463 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.79 
 
 		 601 aa  96.7  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  25.44 
 
 		 822 aa  96.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  23.89 
 
 		 386 aa  96.3  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  27.38 
 
 		 562 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  23.63 
 
 		 450 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  24.18 
 
 		 481 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  22.96 
 
 		 477 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25 
 
 		 392 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  27.06 
 
 		 531 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  24.56 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  22.66 
 
 		 1032 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  23.29 
 
 		 481 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  26.03 
 
 		 401 aa  93.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  23.29 
 
 		 481 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  27.95 
 
 		 485 aa  92.8  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  26.04 
 
 		 461 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  24.18 
 
 		 669 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  29.44 
 
 		 531 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  29.28 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  22.58 
 
 		 595 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  22.25 
 
 		 603 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  28.52 
 
 		 519 aa  91.3  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  29.15 
 
 		 717 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  23.08 
 
 		 490 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  28.17 
 
 		 544 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  30.16 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  24.35 
 
 		 655 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  26.88 
 
 		 533 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>