More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0201 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  100 
 
 
530 aa  1057    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  30.33 
 
 
595 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  29.3 
 
 
601 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  28.33 
 
 
691 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  28.33 
 
 
691 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  26.9 
 
 
694 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  30.75 
 
 
567 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  28.4 
 
 
694 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  27.97 
 
 
691 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  27.97 
 
 
691 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  27.97 
 
 
691 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  26.5 
 
 
691 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  28.91 
 
 
694 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  29.62 
 
 
650 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  29.81 
 
 
498 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  30.38 
 
 
455 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  29.59 
 
 
437 aa  124  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.77 
 
 
453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  30.45 
 
 
466 aa  121  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  28.99 
 
 
600 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  31.89 
 
 
635 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.85 
 
 
539 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  26.47 
 
 
519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  29.32 
 
 
681 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  28.78 
 
 
822 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.16 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  30.28 
 
 
616 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  26.67 
 
 
466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  25.48 
 
 
485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.23 
 
 
588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  29.25 
 
 
450 aa  115  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  32.35 
 
 
513 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  30.27 
 
 
461 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  28.65 
 
 
620 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  26.87 
 
 
526 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  28.93 
 
 
475 aa  113  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.61 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  26.69 
 
 
513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  27.83 
 
 
513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  27.48 
 
 
610 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  29.97 
 
 
456 aa  111  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  27.54 
 
 
513 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.81 
 
 
487 aa  110  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  23.31 
 
 
485 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  29.45 
 
 
530 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.63 
 
 
480 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  27.52 
 
 
470 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  25.62 
 
 
662 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  27.33 
 
 
513 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  25.44 
 
 
377 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.07 
 
 
834 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  24.72 
 
 
384 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  31.65 
 
 
560 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  28.41 
 
 
658 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  26.18 
 
 
485 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  28.37 
 
 
711 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  26.18 
 
 
485 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  31.79 
 
 
440 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  27.68 
 
 
463 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  31.72 
 
 
497 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.83 
 
 
505 aa  107  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  24.66 
 
 
384 aa  107  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  25.44 
 
 
513 aa  106  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  25.91 
 
 
485 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  29.31 
 
 
533 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  25.91 
 
 
485 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.76 
 
 
389 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  24.09 
 
 
463 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  26.98 
 
 
445 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  24.92 
 
 
481 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  29.79 
 
 
531 aa  105  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.43 
 
 
484 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  23.33 
 
 
481 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  23.33 
 
 
481 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  24.86 
 
 
455 aa  104  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  30.35 
 
 
425 aa  104  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.2 
 
 
1055 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  30.03 
 
 
463 aa  104  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  24.86 
 
 
455 aa  104  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  26.52 
 
 
524 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  25.76 
 
 
447 aa  103  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  29.97 
 
 
464 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  27.05 
 
 
499 aa  103  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  22.69 
 
 
483 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  23.78 
 
 
481 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.49 
 
 
508 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  24.51 
 
 
485 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  24.08 
 
 
365 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  30.29 
 
 
457 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  31.33 
 
 
460 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  24.5 
 
 
537 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  26.23 
 
 
389 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  29.23 
 
 
966 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  27.35 
 
 
378 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  23.58 
 
 
490 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  29.92 
 
 
533 aa  102  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  25.63 
 
 
485 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  23.96 
 
 
485 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  23.82 
 
 
353 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  30.12 
 
 
494 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>