More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1514 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  100 
 
 
620 aa  1265    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  31.46 
 
 
655 aa  296  7e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  28.67 
 
 
513 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  32.76 
 
 
523 aa  191  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  28.09 
 
 
485 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  29.12 
 
 
485 aa  183  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  28.47 
 
 
485 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  34.41 
 
 
567 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  28.05 
 
 
485 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  28.28 
 
 
485 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  27.56 
 
 
485 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  27.56 
 
 
485 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  27.11 
 
 
485 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  27.11 
 
 
485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  28.22 
 
 
485 aa  173  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  26.82 
 
 
485 aa  170  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  25.45 
 
 
526 aa  165  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  28.6 
 
 
803 aa  160  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  27.01 
 
 
526 aa  156  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  26.42 
 
 
497 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  33.52 
 
 
822 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  28.61 
 
 
544 aa  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  28.61 
 
 
566 aa  151  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  26.98 
 
 
517 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  28.24 
 
 
591 aa  150  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  26.89 
 
 
519 aa  150  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  28.66 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  28.78 
 
 
447 aa  148  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  27.51 
 
 
466 aa  146  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  28.53 
 
 
455 aa  146  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  28.53 
 
 
455 aa  145  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  25.84 
 
 
529 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  24.6 
 
 
520 aa  143  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  30.79 
 
 
461 aa  140  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  29.18 
 
 
533 aa  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  32.12 
 
 
531 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  30.83 
 
 
499 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  28.03 
 
 
503 aa  134  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  30.06 
 
 
517 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  30.79 
 
 
533 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  30.79 
 
 
533 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  30.79 
 
 
533 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  29.17 
 
 
547 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  26.59 
 
 
562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  25.32 
 
 
603 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.9 
 
 
601 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  29.94 
 
 
551 aa  128  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  27.14 
 
 
437 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  29.53 
 
 
560 aa  125  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  27.79 
 
 
401 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  28.99 
 
 
539 aa  124  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27.01 
 
 
453 aa  123  9e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  28.64 
 
 
533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  25.36 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  28.82 
 
 
530 aa  121  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  25.64 
 
 
530 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  28.79 
 
 
480 aa  120  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  25.29 
 
 
380 aa  120  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  24.27 
 
 
385 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  30.3 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  29.51 
 
 
478 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  27.3 
 
 
486 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  24.87 
 
 
385 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  27.56 
 
 
531 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  25.79 
 
 
377 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.64 
 
 
498 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  28.37 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  27.98 
 
 
635 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  25.25 
 
 
464 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  31.72 
 
 
536 aa  114  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  27.75 
 
 
566 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.63 
 
 
480 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.38 
 
 
595 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  27.94 
 
 
462 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  26.13 
 
 
431 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  28.9 
 
 
674 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.21 
 
 
487 aa  110  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  27.76 
 
 
533 aa  109  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  24.85 
 
 
551 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  23.64 
 
 
389 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  27.06 
 
 
460 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  27.95 
 
 
507 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  24.7 
 
 
426 aa  107  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  26.51 
 
 
531 aa  107  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  23.77 
 
 
363 aa  107  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  26.43 
 
 
463 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  26.43 
 
 
481 aa  107  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  26.43 
 
 
481 aa  107  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3874  beta-lactamase  23.99 
 
 
359 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  27.11 
 
 
481 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  30 
 
 
367 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  26.08 
 
 
481 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  28.28 
 
 
456 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.85 
 
 
342 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  27.68 
 
 
650 aa  104  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  27.55 
 
 
519 aa  104  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  29.28 
 
 
519 aa  104  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  25.9 
 
 
525 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  23.44 
 
 
588 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  25.77 
 
 
444 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>