More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2019 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  100 
 
 		 505 aa  1034    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  48.85 
 
 		 498 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  48.85 
 
 		 498 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  31.08 
 
 		 1055 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  30.71 
 
 		 1032 aa  231  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  28.88 
 
 		 514 aa  194  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  26.51 
 
 		 482 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  26.51 
 
 		 482 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  30.71 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  31.49 
 
 		 485 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  30.71 
 
 		 485 aa  157  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  30.52 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  27.25 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  29.27 
 
 		 485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  31.11 
 
 		 485 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  31.39 
 
 		 485 aa  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  31.11 
 
 		 485 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  30.96 
 
 		 485 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  30.96 
 
 		 485 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  30 
 
 		 529 aa  144  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  28.12 
 
 		 497 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  29.54 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  23.09 
 
 		 595 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  27.1 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  30.84 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  27.1 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  31.21 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  30.24 
 
 		 485 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  30 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  26.39 
 
 		 498 aa  137  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  27.4 
 
 		 669 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  27.79 
 
 		 481 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  24.32 
 
 		 601 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  28.31 
 
 		 463 aa  136  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  27.57 
 
 		 481 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  26.05 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  31.66 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  30.55 
 
 		 477 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  27.17 
 
 		 483 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.22 
 
 		 480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  29.1 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  28.34 
 
 		 486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  28.43 
 
 		 559 aa  131  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  31.59 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  28.8 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.63 
 
 		 362 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  28.12 
 
 		 490 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  28.07 
 
 		 519 aa  127  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  25 
 
 		 600 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  28.53 
 
 		 520 aa  126  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  23.66 
 
 		 453 aa  126  9e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  23.72 
 
 		 588 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  25.67 
 
 		 567 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.45 
 
 		 392 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  31.09 
 
 		 377 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  25.23 
 
 		 560 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  27.22 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  27.81 
 
 		 342 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  24.92 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  26.05 
 
 		 470 aa  120  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  27.58 
 
 		 526 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  27.39 
 
 		 547 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  29.58 
 
 		 543 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  29.58 
 
 		 543 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  26.15 
 
 		 353 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  31.15 
 
 		 662 aa  118  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.55 
 
 		 487 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  28.3 
 
 		 537 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  22.4 
 
 		 533 aa  117  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  26.09 
 
 		 422 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  23.82 
 
 		 591 aa  116  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  22.66 
 
 		 480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  27.64 
 
 		 325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  26.4 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  28.7 
 
 		 593 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  27.57 
 
 		 526 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  23.37 
 
 		 610 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.62 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.57 
 
 		 578 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  28.12 
 
 		 611 aa  114  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  25 
 
 		 455 aa  114  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  25 
 
 		 455 aa  114  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  26.89 
 
 		 371 aa  114  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.95 
 
 		 364 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  26.4 
 
 		 519 aa  114  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  26.07 
 
 		 330 aa  113  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  26.2 
 
 		 338 aa  113  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  27.66 
 
 		 566 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  28.85 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  28.85 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  29.03 
 
 		 413 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  28.85 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  26.48 
 
 		 497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  28.85 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  29.8 
 
 		 471 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  25.82 
 
 		 637 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  28.8 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  26.42 
 
 		 369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  21.68 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  27.27 
 
 		 603 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>