More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0831 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  100 
 
 		 422 aa  869    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  36.19 
 
 		 510 aa  239  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  33.6 
 
 		 364 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  33.25 
 
 		 848 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  31.37 
 
 		 487 aa  179  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.77 
 
 		 578 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  32.03 
 
 		 356 aa  160  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  29.89 
 
 		 395 aa  159  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  27.69 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  29.03 
 
 		 410 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  27.58 
 
 		 434 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  30.67 
 
 		 421 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  30.67 
 
 		 421 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  30.67 
 
 		 412 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  30.67 
 
 		 412 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  30.67 
 
 		 422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  32.08 
 
 		 611 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  29.67 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  30.67 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.03 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  29.67 
 
 		 413 aa  143  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  29.33 
 
 		 416 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  30.48 
 
 		 416 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  30.82 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  30.81 
 
 		 603 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  28.65 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  28.8 
 
 		 477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  27.78 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.61 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  32.88 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  29.21 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  30.15 
 
 		 325 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  31.1 
 
 		 593 aa  137  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  34.91 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  28.61 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.88 
 
 		 446 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  31.37 
 
 		 375 aa  127  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  30.23 
 
 		 369 aa  126  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  31.25 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  30.51 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.92 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.86 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  25.45 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  28.95 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  30.74 
 
 		 375 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  28.62 
 
 		 476 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  30.74 
 
 		 375 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  30.74 
 
 		 377 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  30.14 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.7 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  30.74 
 
 		 377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  31.88 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  31.84 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  29.15 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.66 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  29.05 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  30.37 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  30.37 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  30.37 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  27.25 
 
 		 362 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  29.41 
 
 		 378 aa  120  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  31.01 
 
 		 388 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  31.01 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.01 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  29.07 
 
 		 375 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  31.09 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.09 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.43 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  31.09 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  29.07 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  29.15 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  31.46 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  29.15 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  29.07 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  30.83 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  29.07 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  28.86 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  30.16 
 
 		 330 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.09 
 
 		 505 aa  116  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  28.75 
 
 		 341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  30.66 
 
 		 388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  26.7 
 
 		 338 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.22 
 
 		 389 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  29.91 
 
 		 374 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  28.52 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  28.47 
 
 		 340 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  27.07 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  28.86 
 
 		 481 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  28.52 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  28.86 
 
 		 481 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  28.85 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  31.34 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  27.8 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  27.41 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  30.14 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  26.01 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  28.23 
 
 		 463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  27.35 
 
 		 483 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  29.66 
 
 		 361 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  28.96 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>