More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1457 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  100 
 
 		 325 aa  672    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  33.03 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  33.13 
 
 		 578 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.77 
 
 		 442 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  34.93 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  32.81 
 
 		 487 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  30.42 
 
 		 446 aa  149  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  30.72 
 
 		 446 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  34.35 
 
 		 395 aa  145  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.85 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  30 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  31.76 
 
 		 404 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  31.51 
 
 		 434 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  29.77 
 
 		 848 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  31.96 
 
 		 362 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  29.55 
 
 		 356 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  30.62 
 
 		 413 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  29.13 
 
 		 375 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  30.15 
 
 		 422 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  31.18 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  30.8 
 
 		 416 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  28.85 
 
 		 378 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  30.61 
 
 		 477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  30.36 
 
 		 351 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  28.85 
 
 		 378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  30.23 
 
 		 422 aa  135  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  29.32 
 
 		 403 aa  135  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  30.8 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  30.23 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  28.84 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  30.8 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  28.66 
 
 		 603 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  30.23 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  30.23 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  30.42 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  28.53 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  29.24 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  30.6 
 
 		 375 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  28.06 
 
 		 593 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.25 
 
 		 406 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  27.03 
 
 		 611 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  29.78 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  29.31 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  29.21 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  27.62 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  27.62 
 
 		 377 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  27.94 
 
 		 375 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  29.65 
 
 		 510 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  27.94 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  27.3 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  27.3 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  27.3 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  29.77 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  28.62 
 
 		 476 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  26.42 
 
 		 375 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  30.15 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  29.41 
 
 		 340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  29.41 
 
 		 348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  26.42 
 
 		 377 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  31.62 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  27.16 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  29.41 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  29.41 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  31.02 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  27.95 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  30.38 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.13 
 
 		 595 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  28.65 
 
 		 486 aa  115  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  25.9 
 
 		 470 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  35.22 
 
 		 834 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  27.64 
 
 		 505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  28.57 
 
 		 537 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  31.39 
 
 		 1032 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  25.88 
 
 		 601 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  33.22 
 
 		 388 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  33.33 
 
 		 388 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  33.33 
 
 		 388 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  33.33 
 
 		 388 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.33 
 
 		 388 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  33.33 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  26.86 
 
 		 559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  33.45 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.45 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.33 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  33.46 
 
 		 443 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  33.45 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  33.33 
 
 		 388 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.78 
 
 		 514 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.7 
 
 		 388 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  33.22 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.71 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  28.62 
 
 		 498 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.33 
 
 		 407 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  28.62 
 
 		 498 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  30 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.87 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.33 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  33.33 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.33 
 
 		 407 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  32.96 
 
 		 375 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>