More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4671 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  100 
 
 		 330 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  73.64 
 
 		 330 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  38.8 
 
 		 351 aa  241  9e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  35.19 
 
 		 559 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  31.88 
 
 		 371 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  29.54 
 
 		 537 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  32.71 
 
 		 364 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  30.84 
 
 		 848 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  28.99 
 
 		 543 aa  136  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  28.31 
 
 		 402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.56 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  29.56 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  34.26 
 
 		 493 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  30.16 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  29.21 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.4 
 
 		 543 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.4 
 
 		 543 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  29.9 
 
 		 446 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  31.86 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  30.65 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.17 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  29.51 
 
 		 446 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  30.32 
 
 		 388 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  30.69 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  28.08 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  28.76 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  29.21 
 
 		 547 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.43 
 
 		 476 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  29.1 
 
 		 510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.48 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.09 
 
 		 487 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  29.04 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.18 
 
 		 385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  30.25 
 
 		 375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2137  beta-lactamase  29.94 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113996 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  29.48 
 
 		 385 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  29.61 
 
 		 385 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.96 
 
 		 578 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.29 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  28.93 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  27.12 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  28.85 
 
 		 388 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.85 
 
 		 477 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  32.78 
 
 		 463 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.83 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  29.32 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  28.16 
 
 		 553 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  28.62 
 
 		 462 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  29.17 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.77 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.17 
 
 		 389 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.4 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  29.17 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.77 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  29.17 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  28.53 
 
 		 388 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.49 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  30.36 
 
 		 443 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.85 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  28.61 
 
 		 475 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.07 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  28.96 
 
 		 603 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  28.96 
 
 		 593 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  28.09 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.09 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  30.45 
 
 		 389 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.27 
 
 		 447 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.75 
 
 		 520 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  30.31 
 
 		 377 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  28.7 
 
 		 611 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  27.78 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  23.51 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  27.78 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.22 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  25.63 
 
 		 403 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  28.48 
 
 		 498 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  28.48 
 
 		 498 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.31 
 
 		 505 aa  99.8  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0502  beta-lactamase  28.04 
 
 		 358 aa  99.8  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  30.19 
 
 		 713 aa  99.4  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  28.32 
 
 		 447 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  28.57 
 
 		 370 aa  99.4  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.32 
 
 		 447 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  28.19 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3736  beta-lactamase  29.61 
 
 		 502 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4697  beta-lactamase  28.29 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.168974  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  29.53 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  35.62 
 
 		 470 aa  97.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  26.91 
 
 		 414 aa  96.7  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1378  beta-lactamase  30.5 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.389159  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  27.3 
 
 		 369 aa  96.3  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  32.2 
 
 		 498 aa  95.9  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  31.11 
 
 		 514 aa  95.9  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  26.44 
 
 		 482 aa  95.9  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  24.48 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.85 
 
 		 399 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  29.27 
 
 		 513 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  27.57 
 
 		 358 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.44 
 
 		 480 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  29.71 
 
 		 740 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>