More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0502 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0502  beta-lactamase  100 
 
 		 358 aa  723    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  40.06 
 
 		 366 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  32.08 
 
 		 341 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  31.79 
 
 		 341 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  31.63 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  31.63 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  31.07 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  31.63 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  30.72 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  30.72 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  32.74 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  32.78 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  35.28 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.97 
 
 		 476 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  26.57 
 
 		 434 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.89 
 
 		 578 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.2 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  28.95 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  28.74 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4697  beta-lactamase  27.33 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.168974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.37 
 
 		 392 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.74 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  28.45 
 
 		 510 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  28.72 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.1 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  31.19 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.9 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  34.35 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  29.9 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  29.58 
 
 		 388 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  27.31 
 
 		 325 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.1 
 
 		 385 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  28.65 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.77 
 
 		 385 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  29.84 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  28.44 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  29.58 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.58 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  29.58 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  29.58 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  30.1 
 
 		 443 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  28.13 
 
 		 371 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.45 
 
 		 407 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  27.83 
 
 		 371 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  29.17 
 
 		 375 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.8 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  23.48 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  29.26 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  29.13 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  28.79 
 
 		 445 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  30.31 
 
 		 380 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.03 
 
 		 388 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  25.22 
 
 		 369 aa  102  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  32.89 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  34.01 
 
 		 611 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  29.86 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  29.01 
 
 		 603 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.06 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.81 
 
 		 388 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  30.35 
 
 		 416 aa  99.4  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  29.85 
 
 		 363 aa  99.4  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  28.45 
 
 		 593 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.88 
 
 		 480 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  27.61 
 
 		 369 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  32.11 
 
 		 396 aa  97.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  23.99 
 
 		 442 aa  97.1  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  25.17 
 
 		 450 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  27.7 
 
 		 415 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  29.97 
 
 		 374 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3061  beta-lactamase  29.41 
 
 		 351 aa  96.7  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.502148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  28.47 
 
 		 388 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  28.47 
 
 		 388 aa  96.3  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  28.47 
 
 		 388 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  29.82 
 
 		 389 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.47 
 
 		 388 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  24.92 
 
 		 351 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  32.38 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  27.73 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  30.33 
 
 		 437 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2956  esterase  28.48 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0198492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  28.89 
 
 		 330 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.74 
 
 		 383 aa  92.8  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  26.14 
 
 		 467 aa  92.8  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  28.12 
 
 		 464 aa  92.8  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.97 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  25.29 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  29.79 
 
 		 330 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.97 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.67 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  25.16 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  29.46 
 
 		 547 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  29.1 
 
 		 461 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.81 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  29.23 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  30.42 
 
 		 381 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  28.87 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  29.48 
 
 		 595 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  27.33 
 
 		 429 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25 
 
 		 421 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  30.77 
 
 		 449 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>