More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2956 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2956  esterase  100 
 
 
384 aa  768    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0198492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2741  Beta-lactamase  75.77 
 
 
396 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  45.01 
 
 
409 aa  320  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  44.21 
 
 
398 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  44.21 
 
 
398 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  46.3 
 
 
391 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  44.35 
 
 
396 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0233  putative esterase  47.37 
 
 
399 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0970  putative esterase  47.37 
 
 
399 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.216646  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0408  putative esterase  47.37 
 
 
399 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1365  putative esterase  47.37 
 
 
404 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99407  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  44.35 
 
 
398 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1860  putative esterase  47.09 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  44.5 
 
 
396 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1775  putative esterase  47.09 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0329  beta-lactamase  47.09 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.021088  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  42.74 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  44.09 
 
 
397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0884  putative esterase  44.71 
 
 
398 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1043  beta-lactamase  44.71 
 
 
398 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1108  beta-lactamase  45.7 
 
 
396 aa  280  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0881  putative esterase  44.71 
 
 
398 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  42.39 
 
 
389 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  42.09 
 
 
404 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0087  putative esterase  44.44 
 
 
398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0340  esterase, putative  44.44 
 
 
398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0639  putative esterase  44.44 
 
 
398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.74574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2275  beta-lactamase  43.32 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0956783 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2474  putative esterase  44.44 
 
 
398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.506613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1817  beta-lactamase  44.09 
 
 
397 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  43.28 
 
 
397 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0402  beta-lactamase  44.02 
 
 
392 aa  270  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00394756  normal  0.302831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  44.41 
 
 
398 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6825  beta-lactamase  43.82 
 
 
382 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5920  Beta-lactamase  43.16 
 
 
398 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  41.85 
 
 
389 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3034  beta-lactamase  44.8 
 
 
413 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396527  normal  0.941046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  39.68 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2923  beta-lactamase  41.38 
 
 
394 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2661  beta-lactamase  44.41 
 
 
377 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220174  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4084  esterase (beta-lactamase family)  33.01 
 
 
410 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  33.93 
 
 
417 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  33.85 
 
 
406 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  30.97 
 
 
445 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  31.88 
 
 
370 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  33.84 
 
 
399 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  29.8 
 
 
433 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  35.19 
 
 
407 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  30.2 
 
 
420 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  29.87 
 
 
424 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  32.65 
 
 
613 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  27.22 
 
 
419 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  31.95 
 
 
414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  32.82 
 
 
453 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  32.65 
 
 
417 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  30.87 
 
 
424 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  30.85 
 
 
420 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  32.38 
 
 
423 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  33.79 
 
 
399 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  30.18 
 
 
422 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  29.01 
 
 
424 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  28.57 
 
 
438 aa  149  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  31.46 
 
 
412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  33.69 
 
 
402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  29.12 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  30.5 
 
 
400 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  31.43 
 
 
405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  31.11 
 
 
408 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  30.48 
 
 
454 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  30.91 
 
 
407 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  28.31 
 
 
447 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  29.69 
 
 
426 aa  143  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  30.91 
 
 
405 aa  143  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  29.85 
 
 
424 aa  143  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  29.7 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  30.05 
 
 
418 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  31.89 
 
 
401 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  31.3 
 
 
414 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  31.9 
 
 
401 aa  136  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  30.13 
 
 
430 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  31.2 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  27.05 
 
 
427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  29.87 
 
 
431 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  28.53 
 
 
407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  30.55 
 
 
427 aa  133  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  30.18 
 
 
420 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  28.84 
 
 
435 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  32.62 
 
 
410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  29.27 
 
 
418 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  30.05 
 
 
452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3462  beta-lactamase  31.7 
 
 
406 aa  129  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00219099  normal  0.0121501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  30.59 
 
 
414 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  29.65 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  29.65 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  26.37 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  27.82 
 
 
422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  29.83 
 
 
415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  27.49 
 
 
411 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  26.02 
 
 
407 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  28.17 
 
 
395 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>