More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2259 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  100 
 
 		 416 aa  851    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  45.27 
 
 		 419 aa  296  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  41.12 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3080  beta-lactamase  41.39 
 
 		 440 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.14 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  34.07 
 
 		 361 aa  145  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  31.01 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  30.45 
 
 		 476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  29.72 
 
 		 421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  29.72 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  28.53 
 
 		 446 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  29.37 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.37 
 
 		 421 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.72 
 
 		 422 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  34.57 
 
 		 578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.08 
 
 		 559 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  30.77 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  36.17 
 
 		 487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  27.47 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  27.78 
 
 		 341 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  29.3 
 
 		 340 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.11 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  31.14 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  29.72 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  29.37 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  30.91 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  33.68 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  29.67 
 
 		 416 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  28.27 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  29.82 
 
 		 603 aa  124  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  29.02 
 
 		 416 aa  123  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  30.06 
 
 		 445 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  27.47 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.82 
 
 		 593 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  27.47 
 
 		 348 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  27.47 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  28.47 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  27.47 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  30.81 
 
 		 611 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  27.47 
 
 		 340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  31.83 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  29.26 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  30.21 
 
 		 363 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  30.08 
 
 		 338 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  29.91 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  32.14 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.39 
 
 		 366 aa  114  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  29.85 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  31.34 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  33.33 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  29.48 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  32.5 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  30.62 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.84 
 
 		 446 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  29.01 
 
 		 424 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  36.61 
 
 		 366 aa  111  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  31.15 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  30.97 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  31.27 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.98 
 
 		 514 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  32.05 
 
 		 370 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  35.06 
 
 		 543 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  35.06 
 
 		 543 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  34.29 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  31.7 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  28.25 
 
 		 848 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  34.29 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  36.78 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  29.39 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  29.65 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  34.88 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  29.65 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  34.88 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  35.44 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  26.71 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  30.36 
 
 		 482 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  33.71 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  34.42 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  29.82 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  36.32 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  35.55 
 
 		 364 aa  106  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  27.3 
 
 		 477 aa  106  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  31.62 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  30.75 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  33.98 
 
 		 662 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  30.07 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  31.31 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  31.25 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  32.71 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  34.9 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  25.63 
 
 		 483 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  30.09 
 
 		 505 aa  103  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  30.71 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  36.36 
 
 		 507 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  32.03 
 
 		 370 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  26.15 
 
 		 463 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  30.42 
 
 		 424 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  33.5 
 
 		 330 aa  103  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  29.34 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6825  beta-lactamase  31.77 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>