More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4691 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  100 
 
 		 383 aa  772    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  55.81 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  50.26 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  54.07 
 
 		 399 aa  352  5.9999999999999994e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  50.97 
 
 		 416 aa  352  7e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4687  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  52.53 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  51.16 
 
 		 414 aa  312  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  47.26 
 
 		 409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  41.26 
 
 		 366 aa  239  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  37.15 
 
 		 378 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  39.29 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.59 
 
 		 378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  35.91 
 
 		 388 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  35.61 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.18 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  35.31 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.31 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  35.31 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  35.61 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.31 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  35.01 
 
 		 388 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  36.8 
 
 		 392 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  40 
 
 		 391 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  37.18 
 
 		 388 aa  202  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  35.01 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.52 
 
 		 421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.86 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  35.53 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.86 
 
 		 385 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  35.17 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  33.86 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.93 
 
 		 389 aa  192  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  33.81 
 
 		 389 aa  192  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  32.98 
 
 		 720 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.75 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  33.86 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  34.54 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  34 
 
 		 407 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  41.47 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  32.34 
 
 		 375 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  35.53 
 
 		 389 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  40.53 
 
 		 449 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.1 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  31.61 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  32.1 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  31.61 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.1 
 
 		 388 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.74 
 
 		 411 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  38.27 
 
 		 459 aa  172  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  35.71 
 
 		 420 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  35.9 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  39.56 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  35.52 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  34.24 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.28 
 
 		 379 aa  156  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  34.8 
 
 		 514 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1771  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.67 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.1791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  31.81 
 
 		 428 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  32.5 
 
 		 397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  32.69 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  32.98 
 
 		 416 aa  146  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8159  alkaline D-peptidase  33.33 
 
 		 375 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.533807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.3 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.07 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1263  beta-lactamase  35 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0172767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.16 
 
 		 406 aa  142  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.93 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  36.92 
 
 		 411 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  32.26 
 
 		 713 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  32.68 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2565  beta-lactamase  31.17 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129252  normal  0.077085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  30.93 
 
 		 467 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.81 
 
 		 429 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.23 
 
 		 383 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2405  beta-lactamase  31.58 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261903  hitchhiker  0.00562199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3986  hypothetical protein  35.74 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  29.02 
 
 		 371 aa  133  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  28.32 
 
 		 371 aa  133  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  30.72 
 
 		 431 aa  132  7.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  30.7 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3436  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.43 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.03 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5597  beta-lactamase  31.76 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  29.74 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.74 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  30.87 
 
 		 405 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3053  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.28 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4398  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.85 
 
 		 680 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.419571  decreased coverage  0.00211504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  30.51 
 
 		 740 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0467  beta-lactamase  30.09 
 
 		 381 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  decreased coverage  0.000353045 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  28.35 
 
 		 2457 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  29.72 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.18 
 
 		 438 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  29.69 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2625  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.61 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.93 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  29.63 
 
 		 406 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.28 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.71 
 
 		 681 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.52 
 
 		 420 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0226696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>