More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1263 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1263  beta-lactamase  100 
 
 		 375 aa  762    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0172767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3986  hypothetical protein  72.68 
 
 		 369 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  59.62 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  51.45 
 
 		 383 aa  339  5.9999999999999996e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.14 
 
 		 421 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.84 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  36.67 
 
 		 374 aa  216  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.76 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.88 
 
 		 389 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  35.47 
 
 		 389 aa  185  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.88 
 
 		 389 aa  186  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  39.56 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.73 
 
 		 414 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.8 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  32.76 
 
 		 443 aa  175  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  33.24 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  32.66 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.47 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.75 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.65 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.43 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  31.59 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.66 
 
 		 385 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  34.57 
 
 		 420 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.54 
 
 		 385 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  33.14 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  32.46 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.46 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  32.85 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  32.85 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  33.43 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  33.04 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.04 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  33.04 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.53 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  33.04 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.01 
 
 		 399 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  32.54 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.14 
 
 		 388 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  31.95 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  35.42 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  32.54 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.77 
 
 		 416 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  33.8 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.77 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  36.51 
 
 		 370 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  34.24 
 
 		 378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  31.87 
 
 		 720 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  31.91 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  31.75 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  33.94 
 
 		 409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  32.29 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.3 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.98 
 
 		 514 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.3 
 
 		 378 aa  133  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  33.24 
 
 		 449 aa  133  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  34.69 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  30.85 
 
 		 428 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  30.92 
 
 		 381 aa  125  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  32.72 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8159  alkaline D-peptidase  32.96 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.533807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4687  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.04 
 
 		 373 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1771  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.18 
 
 		 380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.1791 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2625  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.68 
 
 		 417 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2565  beta-lactamase  31.18 
 
 		 378 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129252  normal  0.077085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3436  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.22 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.55 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  32.55 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.84 
 
 		 415 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.05 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.66 
 
 		 406 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  28.76 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3215  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.75 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  28.7 
 
 		 713 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5597  beta-lactamase  28.45 
 
 		 406 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  31.96 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  31.75 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  25.55 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  26.84 
 
 		 510 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  27.54 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.23 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10400  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.71 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.15445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10390  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.59 
 
 		 426 aa  100  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  34.94 
 
 		 479 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2537  beta-lactamase  29.9 
 
 		 393 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  29.72 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  27.83 
 
 		 434 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  29.62 
 
 		 401 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  28.01 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3061  beta-lactamase  29.27 
 
 		 351 aa  96.3  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.502148  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  28.01 
 
 		 371 aa  96.3  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.84 
 
 		 578 aa  96.3  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  28.37 
 
 		 417 aa  96.3  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  26.95 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  32.87 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  29.39 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0467  beta-lactamase  27.42 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  decreased coverage  0.000353045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  25.83 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2114  hypothetical protein  38.26 
 
 		 213 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.321684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>