More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3352 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  100 
 
 		 416 aa  847    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  71.43 
 
 		 420 aa  628  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  50.83 
 
 		 411 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.42 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.7 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.84 
 
 		 378 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.72 
 
 		 411 aa  186  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.76 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  33.88 
 
 		 429 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.98 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  35.06 
 
 		 459 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  36.52 
 
 		 514 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  33.92 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  31.35 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  34.34 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2625  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.24 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  35.14 
 
 		 378 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  37.62 
 
 		 349 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  33.78 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.81 
 
 		 385 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  29.53 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.7 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  30.81 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.53 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1263  beta-lactamase  33.8 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0172767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.08 
 
 		 407 aa  160  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  32.7 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.87 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  33.94 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.86 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.82 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.3 
 
 		 389 aa  156  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  30.14 
 
 		 389 aa  155  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.59 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  32.67 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  32.42 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  32.04 
 
 		 388 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.76 
 
 		 383 aa  152  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  31.33 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.33 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  31.33 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  31.33 
 
 		 388 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  30.16 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  30.72 
 
 		 720 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.53 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  30.53 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  30.53 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  31.39 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3986  hypothetical protein  37.12 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  30.53 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  31.39 
 
 		 388 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4687  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.45 
 
 		 373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  33.53 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.96 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.79 
 
 		 413 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.29 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1771  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.92 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.1791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  34.08 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  31.65 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  33.02 
 
 		 382 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.7 
 
 		 415 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  31.91 
 
 		 406 aa  141  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.05 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3436  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.96 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  30.73 
 
 		 428 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.75 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  30.81 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.77 
 
 		 447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  32.45 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  30.46 
 
 		 397 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.32 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  31.09 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.42 
 
 		 420 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5597  beta-lactamase  30.52 
 
 		 406 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.61 
 
 		 383 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2405  beta-lactamase  31.43 
 
 		 382 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261903  hitchhiker  0.00562199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  30.91 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.72 
 
 		 487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.96 
 
 		 420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  33.21 
 
 		 405 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  31.15 
 
 		 409 aa  126  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8159  alkaline D-peptidase  32.25 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.533807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2565  beta-lactamase  30.48 
 
 		 378 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129252  normal  0.077085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.76 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1378  beta-lactamase  31.29 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.389159  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  28.57 
 
 		 450 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3510  beta-lactamase  30 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  28.01 
 
 		 713 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.61 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.89 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  28.34 
 
 		 371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2315  beta-lactamase  31.01 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00477679  hitchhiker  0.0000358597 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3061  beta-lactamase  29.86 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.502148  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  28.34 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3215  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.82 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  27.91 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1013  beta-lactamase  29.04 
 
 		 367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3254  beta-lactamase  28.84 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.655061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>