More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6210 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  100 
 
 		 391 aa  790    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.26 
 
 		 390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39.22 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  38.66 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.27 
 
 		 416 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  38.94 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  41.06 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  40.81 
 
 		 407 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  37 
 
 		 388 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  40.97 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  40.3 
 
 		 443 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.62 
 
 		 389 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  41.89 
 
 		 388 aa  235  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  42.9 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  41.19 
 
 		 375 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  36.46 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  41.89 
 
 		 388 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  39.24 
 
 		 385 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.44 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  41.55 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  42.45 
 
 		 389 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  41.55 
 
 		 388 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  41.55 
 
 		 388 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  39.47 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.46 
 
 		 388 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  40.88 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  43.42 
 
 		 399 aa  229  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  38.31 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  38.31 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  37.92 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  37.92 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  37.19 
 
 		 720 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  40.54 
 
 		 388 aa  226  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  41.64 
 
 		 409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  40.89 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  43.57 
 
 		 392 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  39.55 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.95 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  46.04 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40 
 
 		 383 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  38.24 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  34.44 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  40.4 
 
 		 428 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  36.74 
 
 		 514 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  36.29 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4687  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.03 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.92 
 
 		 421 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  37.2 
 
 		 374 aa  185  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  35.19 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  35.66 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  35.24 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.45 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1771  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.36 
 
 		 380 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.1791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  39.29 
 
 		 449 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  37.99 
 
 		 397 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  33.99 
 
 		 374 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  35.25 
 
 		 459 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.15 
 
 		 415 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.76 
 
 		 413 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2565  beta-lactamase  34.07 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129252  normal  0.077085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8159  alkaline D-peptidase  35.71 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.533807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.54 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.69 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0467  beta-lactamase  34.73 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  decreased coverage  0.000353045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  35.04 
 
 		 416 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.37 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  31.48 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.03 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.1 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.1 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  37.88 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  29.78 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  27.91 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.85 
 
 		 420 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  27.91 
 
 		 371 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.93 
 
 		 420 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.62 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1263  beta-lactamase  31.3 
 
 		 375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0172767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.23 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  32.19 
 
 		 740 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4398  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.56 
 
 		 680 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.419571  decreased coverage  0.00211504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  29.41 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  31.74 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  31.9 
 
 		 713 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.86 
 
 		 429 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5597  beta-lactamase  31.85 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.88 
 
 		 447 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  31.16 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  30.33 
 
 		 442 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  30.59 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.59 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  29.53 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  30.85 
 
 		 406 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  33.22 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2405  beta-lactamase  32.38 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261903  hitchhiker  0.00562199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3986  hypothetical protein  30.1 
 
 		 369 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  31.07 
 
 		 593 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3689  beta-lactamase  31.05 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  30.96 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  32.25 
 
 		 603 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>