More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5306 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  100 
 
 		 411 aa  822    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  49.87 
 
 		 416 aa  360  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  47.24 
 
 		 420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.59 
 
 		 378 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.34 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.87 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  39.71 
 
 		 349 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2625  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.66 
 
 		 417 aa  173  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  33.15 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  33.95 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  32.88 
 
 		 374 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.5 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  36.17 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.79 
 
 		 389 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.79 
 
 		 390 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  29.92 
 
 		 443 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  34.59 
 
 		 392 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.82 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.86 
 
 		 399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  37.13 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.3 
 
 		 413 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  34.35 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  36.76 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  30.38 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  31.85 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.95 
 
 		 385 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.43 
 
 		 389 aa  152  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  29.83 
 
 		 385 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.83 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.82 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.2 
 
 		 514 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  37.45 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  37.09 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.48 
 
 		 407 aa  150  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  36.73 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.73 
 
 		 389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  36.73 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  36.73 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  29.72 
 
 		 375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.58 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.19 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  29.41 
 
 		 720 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.42 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  33.95 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1771  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.16 
 
 		 380 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.1791 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  28.14 
 
 		 389 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  30.79 
 
 		 388 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  30.79 
 
 		 388 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  30.79 
 
 		 388 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.79 
 
 		 388 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  35.4 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.79 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.44 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  31.4 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  30.63 
 
 		 428 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.92 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3986  hypothetical protein  34.11 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  29.57 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1263  beta-lactamase  32.29 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0172767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  32.4 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  34.42 
 
 		 381 aa  136  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2405  beta-lactamase  30.96 
 
 		 382 aa  132  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261903  hitchhiker  0.00562199 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.63 
 
 		 414 aa  132  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  30.31 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.74 
 
 		 391 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3436  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.68 
 
 		 381 aa  131  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.28 
 
 		 366 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  30.31 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10390  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.3 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.43 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  28.91 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.38 
 
 		 447 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  32.15 
 
 		 450 aa  126  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4687  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.23 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  30.75 
 
 		 409 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  28.49 
 
 		 713 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.69 
 
 		 420 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  28.12 
 
 		 447 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.12 
 
 		 447 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.35 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.7 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  29.25 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.74 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10400  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.37 
 
 		 421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.15445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.57 
 
 		 487 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  27.69 
 
 		 371 aa  119  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  34.59 
 
 		 510 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  29 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  29.8 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  29.2 
 
 		 380 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.13 
 
 		 578 aa  116  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  27.81 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  32.12 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  31.5 
 
 		 2457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  29.45 
 
 		 409 aa  111  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3053  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.53 
 
 		 420 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8159  alkaline D-peptidase  27.9 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.533807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.51 
 
 		 379 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  28.45 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3215  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.17 
 
 		 386 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>