More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0603 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  100 
 
 
409 aa  835    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  45.31 
 
 
378 aa  233  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0059  beta-lactamase  35.12 
 
 
383 aa  176  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  31.02 
 
 
367 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.86 
 
 
578 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  31.15 
 
 
416 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  30.77 
 
 
487 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  33.97 
 
 
479 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  28.44 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  30.25 
 
 
476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  25.23 
 
 
470 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  27.48 
 
 
443 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  28.31 
 
 
477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  26.74 
 
 
434 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.57 
 
 
356 aa  113  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  26.35 
 
 
446 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.23 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  29.52 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.54 
 
 
378 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2174  beta-lactamase  28.67 
 
 
429 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  30.04 
 
 
559 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  28.42 
 
 
364 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  28.48 
 
 
510 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.88 
 
 
389 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.27 
 
 
342 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  33.47 
 
 
389 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  28.57 
 
 
405 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  24.93 
 
 
364 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.31 
 
 
601 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  30.74 
 
 
633 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  27.78 
 
 
442 aa  103  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  30.64 
 
 
588 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2236  beta-lactamase  28 
 
 
428 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.53 
 
 
681 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  26.12 
 
 
417 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  28.79 
 
 
363 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.72 
 
 
414 aa  99.8  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  24.05 
 
 
514 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.95 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.78 
 
 
407 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.8 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  29.48 
 
 
361 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  28 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.4 
 
 
362 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.52 
 
 
385 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.52 
 
 
385 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  31.01 
 
 
547 aa  96.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.82 
 
 
834 aa  96.7  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  26.93 
 
 
375 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  26.98 
 
 
424 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  27.51 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  28.81 
 
 
349 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  26.73 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  27.47 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.33 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  24.06 
 
 
543 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1876  beta-lactamase  31.15 
 
 
493 aa  95.9  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  24.06 
 
 
543 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.82 
 
 
407 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  24.83 
 
 
422 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  27.96 
 
 
431 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  26.87 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  28.46 
 
 
389 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  27.06 
 
 
450 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  29.5 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  25.7 
 
 
375 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  25.73 
 
 
388 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  25.73 
 
 
388 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.2 
 
 
385 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  26.89 
 
 
720 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.73 
 
 
388 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  25.73 
 
 
388 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  28.47 
 
 
388 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  28.79 
 
 
388 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.79 
 
 
389 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  28.79 
 
 
388 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  26.89 
 
 
391 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  28.52 
 
 
416 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  26.2 
 
 
376 aa  94.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  28.14 
 
 
388 aa  94  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  26.55 
 
 
369 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  29.32 
 
 
388 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.15 
 
 
480 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.3 
 
 
413 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  29.28 
 
 
370 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  27.93 
 
 
611 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  27.76 
 
 
388 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  27 
 
 
445 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  24.71 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  25.97 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  29.37 
 
 
429 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  25.97 
 
 
412 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  29.96 
 
 
330 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  24.72 
 
 
462 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  31.75 
 
 
695 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  28.4 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  30.74 
 
 
383 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  24.26 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.7 
 
 
595 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  25.5 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>