More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2538 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  100 
 
 		 416 aa  831    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  50.39 
 
 		 420 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  52.92 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  50.69 
 
 		 467 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  50.41 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  50.68 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3053  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  45.61 
 
 		 420 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  43.32 
 
 		 438 aa  305  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  43.8 
 
 		 405 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  43.25 
 
 		 405 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  43.25 
 
 		 405 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  44.2 
 
 		 447 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  43.94 
 
 		 447 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  43.94 
 
 		 447 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  42.43 
 
 		 740 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  41.59 
 
 		 381 aa  249  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.52 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.43 
 
 		 406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  34.95 
 
 		 713 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  36.78 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  37.85 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.91 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  35.52 
 
 		 429 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  34.23 
 
 		 434 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.5 
 
 		 421 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  36.29 
 
 		 370 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2537  beta-lactamase  36.2 
 
 		 393 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  35.6 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  42.4 
 
 		 415 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  32.27 
 
 		 389 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.91 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  32.37 
 
 		 443 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.02 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.18 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.33 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  36.49 
 
 		 366 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.15 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.36 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.4 
 
 		 388 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.48 
 
 		 389 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.1 
 
 		 407 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  31.17 
 
 		 385 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  33.74 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  31.01 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.59 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  31.01 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.08 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  32.28 
 
 		 388 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4687  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.03 
 
 		 373 aa  149  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.59 
 
 		 388 aa  149  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  30.29 
 
 		 375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  30.1 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  29.53 
 
 		 371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  33.13 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  33.33 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  33.13 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.13 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  33.13 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.9 
 
 		 385 aa  147  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.2 
 
 		 414 aa  147  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8159  alkaline D-peptidase  33.13 
 
 		 375 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.533807 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  29.27 
 
 		 371 aa  145  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  35.44 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.98 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  31.93 
 
 		 720 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  31.12 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.53 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  33.86 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  30.95 
 
 		 388 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  30.95 
 
 		 388 aa  143  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.95 
 
 		 388 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  30.95 
 
 		 388 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  31.65 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  34.59 
 
 		 397 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3689  beta-lactamase  31.83 
 
 		 422 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  34.75 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  34.12 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  32.66 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  30.5 
 
 		 374 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  31.83 
 
 		 378 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  35.58 
 
 		 392 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  32.94 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1771  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.86 
 
 		 380 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.1791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  32.13 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  31.96 
 
 		 450 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.48 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  31.44 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  36.56 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  32.9 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  30.99 
 
 		 406 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  31.54 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  28.81 
 
 		 2457 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2565  beta-lactamase  29.97 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129252  normal  0.077085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2315  beta-lactamase  33.62 
 
 		 440 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00477679  hitchhiker  0.0000358597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.17 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1378  beta-lactamase  33.94 
 
 		 337 aa  123  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.389159  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2405  beta-lactamase  31.58 
 
 		 382 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261903  hitchhiker  0.00562199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3510  beta-lactamase  28.57 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1885  hypothetical protein  27.41 
 
 		 420 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1874  hypothetical protein  27.41 
 
 		 420 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>