More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0999 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  100 
 
 
367 aa  761    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  39.76 
 
 
378 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  32.04 
 
 
477 aa  170  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  31.02 
 
 
409 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  32.66 
 
 
487 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2174  beta-lactamase  30.67 
 
 
429 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  33.22 
 
 
356 aa  150  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  30.96 
 
 
578 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2236  beta-lactamase  31.38 
 
 
428 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0059  beta-lactamase  31.31 
 
 
383 aa  146  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476107  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.31 
 
 
392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  27.86 
 
 
377 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  31.27 
 
 
479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.32 
 
 
442 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  29.39 
 
 
543 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  29.39 
 
 
543 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.82 
 
 
446 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  29.73 
 
 
445 aa  133  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  28.14 
 
 
470 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  32.29 
 
 
476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  27.57 
 
 
462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.26 
 
 
559 aa  129  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  30.72 
 
 
593 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  29.5 
 
 
537 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.25 
 
 
601 aa  126  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  31.62 
 
 
603 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  27.63 
 
 
342 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  28.07 
 
 
614 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  30.21 
 
 
498 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  30.41 
 
 
611 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  29.59 
 
 
533 aa  119  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  30.5 
 
 
420 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  27.99 
 
 
526 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  26.91 
 
 
371 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  29.49 
 
 
635 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  26.91 
 
 
371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  28.33 
 
 
388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  26.63 
 
 
455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  29.7 
 
 
338 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.33 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  27.56 
 
 
443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.25 
 
 
588 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  30.71 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  27.35 
 
 
482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  27.64 
 
 
388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  27.99 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.27 
 
 
388 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  27.07 
 
 
482 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  25.69 
 
 
485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  26.04 
 
 
364 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.38 
 
 
595 aa  113  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.73 
 
 
406 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  27.64 
 
 
388 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  28.36 
 
 
375 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  27.27 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  25.38 
 
 
496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.27 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  27.27 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  27.47 
 
 
497 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  27.27 
 
 
475 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  25.53 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.69 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  28.12 
 
 
450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  27.27 
 
 
388 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.84 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  27.45 
 
 
374 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  26.87 
 
 
386 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  26.17 
 
 
650 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.42 
 
 
520 aa  109  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  28.69 
 
 
713 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  29.63 
 
 
401 aa  109  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  27.24 
 
 
378 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  29.5 
 
 
463 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  24.65 
 
 
485 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.52 
 
 
485 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  27.27 
 
 
394 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.52 
 
 
485 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  27.01 
 
 
330 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  27.24 
 
 
378 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  26.56 
 
 
498 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  28.45 
 
 
411 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0071  beta-lactamase  27.43 
 
 
373 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.844307 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  26.56 
 
 
498 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  26.94 
 
 
410 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  24.65 
 
 
485 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  27.61 
 
 
424 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  26.87 
 
 
379 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.42 
 
 
385 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  26.49 
 
 
378 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  27.24 
 
 
383 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  26.51 
 
 
600 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  25.38 
 
 
482 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  26.1 
 
 
523 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  26.7 
 
 
848 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  28.96 
 
 
966 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  24.93 
 
 
485 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  26.96 
 
 
388 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  24.3 
 
 
485 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.67 
 
 
385 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.96 
 
 
388 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>