More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9203 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  100 
 
 		 635 aa  1269    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  41.02 
 
 		 661 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  45.23 
 
 		 674 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  37.29 
 
 		 633 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  36.59 
 
 		 650 aa  340  5.9999999999999996e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  35.28 
 
 		 533 aa  280  7e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  35.19 
 
 		 657 aa  279  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  28.63 
 
 		 669 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  35.6 
 
 		 778 aa  259  9e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  30.39 
 
 		 658 aa  259  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  34.1 
 
 		 677 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  26.81 
 
 		 662 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0784  beta-lactamase  30.09 
 
 		 638 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  36.24 
 
 		 695 aa  207  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  31.61 
 
 		 636 aa  187  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  29.45 
 
 		 637 aa  173  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  31.3 
 
 		 717 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  30.03 
 
 		 513 aa  146  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  29.74 
 
 		 513 aa  146  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4139  beta-lactamase  34.12 
 
 		 422 aa  143  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  34.34 
 
 		 498 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  29.45 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  29.15 
 
 		 513 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  35.71 
 
 		 601 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.65 
 
 		 595 aa  127  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  29.77 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  29.67 
 
 		 539 aa  126  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  32.3 
 
 		 497 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  29.47 
 
 		 466 aa  123  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  38.31 
 
 		 5698 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  31.5 
 
 		 580 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  30.92 
 
 		 464 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  32.29 
 
 		 560 aa  120  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  33.25 
 
 		 480 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  31.89 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  28.81 
 
 		 447 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  29.49 
 
 		 367 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  30.67 
 
 		 359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  31.55 
 
 		 426 aa  115  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  28.29 
 
 		 359 aa  114  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  25.66 
 
 		 498 aa  114  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  25.66 
 
 		 498 aa  114  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.11 
 
 		 544 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  33.44 
 
 		 574 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  29.47 
 
 		 437 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.58 
 
 		 588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  34.46 
 
 		 966 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  28.12 
 
 		 455 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  28.86 
 
 		 398 aa  112  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.43 
 
 		 543 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.43 
 
 		 543 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  30.36 
 
 		 480 aa  111  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  28.93 
 
 		 455 aa  110  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  28.84 
 
 		 455 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  30.6 
 
 		 377 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  28.83 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  33.02 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  26.54 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  27.82 
 
 		 620 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  26.67 
 
 		 600 aa  107  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.07 
 
 		 513 aa  107  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  25.81 
 
 		 353 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  27.15 
 
 		 486 aa  106  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  28.06 
 
 		 526 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  30.72 
 
 		 461 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.65 
 
 		 520 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  29.11 
 
 		 530 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  25.57 
 
 		 614 aa  105  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  27.61 
 
 		 616 aa  104  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.63 
 
 		 514 aa  104  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  29.53 
 
 		 466 aa  103  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  28.36 
 
 		 460 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  28.1 
 
 		 421 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  26.75 
 
 		 559 aa  103  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  33.22 
 
 		 784 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.77 
 
 		 681 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  23.06 
 
 		 380 aa  103  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  27.88 
 
 		 711 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  28.46 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  28.08 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  35.28 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  28.1 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  29.64 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  28.72 
 
 		 507 aa  102  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  31.42 
 
 		 476 aa  102  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  26.03 
 
 		 519 aa  102  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  25.62 
 
 		 483 aa  102  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  26.59 
 
 		 523 aa  101  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  27.84 
 
 		 529 aa  101  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.64 
 
 		 484 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  26.03 
 
 		 447 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  31.77 
 
 		 507 aa  100  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  33.33 
 
 		 362 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  35.4 
 
 		 356 aa  100  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  27.69 
 
 		 421 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  28.26 
 
 		 431 aa  100  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  27.69 
 
 		 412 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  28.12 
 
 		 517 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  26.27 
 
 		 517 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  27.93 
 
 		 567 aa  100  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>