More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1357 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  100 
 
 		 378 aa  764    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  38.75 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  41.33 
 
 		 409 aa  233  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0059  beta-lactamase  36.42 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476107  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  35.69 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.94 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  33.53 
 
 		 356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.75 
 
 		 578 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.21 
 
 		 559 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  33.03 
 
 		 553 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2174  beta-lactamase  26.33 
 
 		 429 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.02 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  28.03 
 
 		 470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  26.89 
 
 		 537 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  32.7 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.83 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  32.08 
 
 		 601 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2236  beta-lactamase  26.61 
 
 		 428 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.87 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  24.44 
 
 		 485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.44 
 
 		 485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.44 
 
 		 485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  23.06 
 
 		 485 aa  126  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  27.13 
 
 		 477 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  26.76 
 
 		 462 aa  125  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  23.61 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  29.61 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  24.16 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  24.22 
 
 		 485 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  31.53 
 
 		 547 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  28.8 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.15 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.74 
 
 		 595 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  23.33 
 
 		 485 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.15 
 
 		 543 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.15 
 
 		 543 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  29.69 
 
 		 369 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  31.09 
 
 		 475 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.56 
 
 		 476 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.66 
 
 		 480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  31.9 
 
 		 389 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  25.66 
 
 		 496 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  30.14 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  29.14 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  31.46 
 
 		 593 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  30.35 
 
 		 834 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.93 
 
 		 533 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  28.83 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  28.86 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  23.31 
 
 		 485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  29.74 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.97 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  31.13 
 
 		 603 aa  116  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  28.16 
 
 		 498 aa  116  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  26.83 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.18 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  31.27 
 
 		 611 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  27.78 
 
 		 620 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  28.91 
 
 		 848 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.62 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  27.33 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  25.5 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  28.53 
 
 		 410 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  24.55 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  28.79 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  30.49 
 
 		 966 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.32 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.32 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.63 
 
 		 505 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  25 
 
 		 485 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  26.35 
 
 		 501 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  27.71 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  25.3 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  30.72 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  26.83 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  29.66 
 
 		 361 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  27.04 
 
 		 330 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  24.85 
 
 		 434 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  26.29 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  28.02 
 
 		 385 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  26.22 
 
 		 378 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  27.86 
 
 		 662 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.98 
 
 		 407 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  24.9 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  35.36 
 
 		 588 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  24.9 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  24.9 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  29.18 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.85 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  25.76 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  29.86 
 
 		 450 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  25.97 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  29.73 
 
 		 600 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.46 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  25.85 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0071  beta-lactamase  29.78 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.844307 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  25.87 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  23.13 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  24.85 
 
 		 403 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  27.12 
 
 		 405 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>