More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2991 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  100 
 
 
475 aa  937    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  48.8 
 
 
488 aa  372  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  47.72 
 
 
457 aa  331  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30360  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  43.91 
 
 
550 aa  251  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0126  beta-lactamase  35.34 
 
 
456 aa  233  6e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  34.86 
 
 
498 aa  203  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  34.06 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  33.33 
 
 
593 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  33.43 
 
 
603 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  33.43 
 
 
611 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  29.13 
 
 
519 aa  124  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  28.71 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  31.04 
 
 
443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27.91 
 
 
464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25.75 
 
 
446 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  32.69 
 
 
356 aa  120  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  31.09 
 
 
378 aa  120  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  32.62 
 
 
388 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  32.62 
 
 
388 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.63 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  29.55 
 
 
450 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  30.38 
 
 
389 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  32.44 
 
 
476 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.5 
 
 
388 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  31.58 
 
 
463 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.81 
 
 
342 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  30.19 
 
 
451 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  26.98 
 
 
537 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  27.22 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  28.95 
 
 
467 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.63 
 
 
392 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.55 
 
 
388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  25.57 
 
 
442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.53 
 
 
389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.9 
 
 
388 aa  114  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  28.45 
 
 
501 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  28.93 
 
 
530 aa  113  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.12 
 
 
487 aa  113  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  29.55 
 
 
388 aa  113  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  29.55 
 
 
388 aa  113  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  29.55 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.55 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.19 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  30.63 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  29.22 
 
 
388 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  28.31 
 
 
369 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  29.57 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  29.57 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  30.54 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  29.57 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.57 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  25.83 
 
 
417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  30.51 
 
 
375 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.97 
 
 
414 aa  110  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  27.39 
 
 
486 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  30.61 
 
 
385 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  25.46 
 
 
510 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.27 
 
 
407 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  28.97 
 
 
713 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.8 
 
 
385 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  28.22 
 
 
559 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2137  beta-lactamase  32.52 
 
 
366 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.113996 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.61 
 
 
385 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  27.84 
 
 
456 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.8 
 
 
385 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  27.5 
 
 
529 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.58 
 
 
366 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  27.66 
 
 
524 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  31.07 
 
 
389 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  27.94 
 
 
720 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  29.54 
 
 
446 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  27.93 
 
 
590 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.36 
 
 
442 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  32.43 
 
 
463 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.63 
 
 
513 aa  106  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  26.78 
 
 
514 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.54 
 
 
601 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  25.97 
 
 
543 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.06 
 
 
453 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  28.61 
 
 
330 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.59 
 
 
407 aa  105  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  25.97 
 
 
543 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  28.82 
 
 
453 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  22.3 
 
 
445 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  26.99 
 
 
578 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  26.59 
 
 
384 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.75 
 
 
405 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  26.67 
 
 
415 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  34.74 
 
 
377 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  28.37 
 
 
461 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.75 
 
 
405 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.75 
 
 
405 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  26.79 
 
 
462 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  33.8 
 
 
361 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.38 
 
 
413 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  30.03 
 
 
401 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  28.17 
 
 
371 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  29.8 
 
 
429 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.98 
 
 
1055 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  27.67 
 
 
450 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>