More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2231 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  100 
 
 		 384 aa  791    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2923  beta-lactamase  28.5 
 
 		 423 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.633134 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  27.31 
 
 		 511 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.16 
 
 		 453 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  26.54 
 
 		 533 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  24.46 
 
 		 669 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.32 
 
 		 498 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  30.09 
 
 		 497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  27.17 
 
 		 466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  24.86 
 
 		 658 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  24.72 
 
 		 530 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  26.74 
 
 		 470 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  25.74 
 
 		 513 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  26.18 
 
 		 519 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.7 
 
 		 544 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.24 
 
 		 595 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  26.5 
 
 		 450 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.53 
 
 		 520 aa  106  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  25.66 
 
 		 513 aa  106  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  25.97 
 
 		 588 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  26.59 
 
 		 475 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  24.3 
 
 		 657 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  26.38 
 
 		 695 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  24.61 
 
 		 529 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  26.3 
 
 		 513 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27.22 
 
 		 464 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  24.92 
 
 		 447 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  30.96 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  25 
 
 		 616 aa  100  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  24.18 
 
 		 401 aa  99.8  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  25.53 
 
 		 513 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  24.42 
 
 		 505 aa  99  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  25.14 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  24.87 
 
 		 635 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  22.65 
 
 		 601 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  27 
 
 		 386 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.69 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  28.57 
 
 		 395 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  25.08 
 
 		 513 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  26.48 
 
 		 510 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  27.3 
 
 		 662 aa  97.1  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  23.24 
 
 		 419 aa  97.4  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  25.15 
 
 		 650 aa  97.1  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  24.4 
 
 		 353 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  22.43 
 
 		 494 aa  97.1  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  26.96 
 
 		 513 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3823  beta-lactamase  24.57 
 
 		 398 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  24.01 
 
 		 437 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  23.9 
 
 		 486 aa  96.3  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25.19 
 
 		 446 aa  96.3  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  24.35 
 
 		 600 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  24.05 
 
 		 614 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  26.57 
 
 		 452 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  25.24 
 
 		 677 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.94 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  26.25 
 
 		 407 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  23.68 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  26.16 
 
 		 590 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  24.32 
 
 		 1055 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  24.21 
 
 		 342 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  23.88 
 
 		 446 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  25.79 
 
 		 453 aa  94  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  26.55 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  24.32 
 
 		 481 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  26.03 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  24.93 
 
 		 443 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  24.32 
 
 		 481 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  26.4 
 
 		 442 aa  93.6  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  24.56 
 
 		 424 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  25.95 
 
 		 463 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  24.13 
 
 		 483 aa  93.2  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  22.58 
 
 		 517 aa  93.2  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  25 
 
 		 481 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  22.6 
 
 		 485 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.19 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  23.61 
 
 		 477 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  23.88 
 
 		 633 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  30.58 
 
 		 713 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  24.37 
 
 		 514 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  24.41 
 
 		 574 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  26.05 
 
 		 481 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  25.77 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  22.58 
 
 		 523 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  25.13 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  24.03 
 
 		 485 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  26.15 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  24.53 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  25.23 
 
 		 424 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  26.19 
 
 		 560 aa  90.1  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  22.76 
 
 		 636 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  28.79 
 
 		 834 aa  90.1  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.69 
 
 		 488 aa  90.1  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  23.18 
 
 		 483 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  23.72 
 
 		 497 aa  89.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  22.94 
 
 		 507 aa  89.4  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  24.3 
 
 		 363 aa  89.4  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.03 
 
 		 484 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  25.07 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  23.73 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  27.21 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>