More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0349 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  100 
 
 
407 aa  823    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  48.61 
 
 
407 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  48.1 
 
 
407 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  47.51 
 
 
411 aa  354  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  47 
 
 
415 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  47.77 
 
 
407 aa  349  6e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  46.34 
 
 
440 aa  348  9e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  47.34 
 
 
409 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  48.4 
 
 
402 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  46.09 
 
 
414 aa  308  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  43.49 
 
 
414 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  41.89 
 
 
445 aa  296  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  42.86 
 
 
406 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  41.12 
 
 
422 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  41.56 
 
 
453 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  42.13 
 
 
440 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  39.6 
 
 
419 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  38.57 
 
 
430 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  39.55 
 
 
435 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  42.17 
 
 
420 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  41.71 
 
 
418 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  39.3 
 
 
444 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  41.02 
 
 
420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  40.1 
 
 
408 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  38.02 
 
 
431 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  38.42 
 
 
426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  39.29 
 
 
411 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  43.48 
 
 
436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  38.89 
 
 
411 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  39.85 
 
 
438 aa  266  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  41.01 
 
 
424 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  41.1 
 
 
430 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  42.03 
 
 
417 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  38.44 
 
 
447 aa  259  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  39.85 
 
 
422 aa  260  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  40.49 
 
 
400 aa  259  7e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  39.23 
 
 
424 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  39.62 
 
 
424 aa  256  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  40.53 
 
 
420 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  38 
 
 
424 aa  255  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  39.61 
 
 
420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  39.61 
 
 
420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  40.75 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  41.65 
 
 
437 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  40.83 
 
 
414 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  39.29 
 
 
417 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  39.55 
 
 
454 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  38.69 
 
 
405 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  41.19 
 
 
426 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  38.85 
 
 
405 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  40.84 
 
 
405 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  36.19 
 
 
423 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  37.35 
 
 
407 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  40.15 
 
 
410 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  38.31 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  37.95 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  39.84 
 
 
613 aa  233  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  35.09 
 
 
433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  35.73 
 
 
418 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  38.16 
 
 
399 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  38.5 
 
 
427 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  39.06 
 
 
416 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  35.71 
 
 
406 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  37.33 
 
 
401 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  35.42 
 
 
452 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  36.78 
 
 
401 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  36.78 
 
 
401 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  36.78 
 
 
401 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  35.75 
 
 
468 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  34.58 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  35.01 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  36.27 
 
 
401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  36.44 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  35.22 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  31.22 
 
 
427 aa  196  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  37.53 
 
 
409 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  33.96 
 
 
395 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  34.54 
 
 
412 aa  192  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  35.86 
 
 
422 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  34.52 
 
 
437 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  35.47 
 
 
438 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  32.25 
 
 
395 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  34.09 
 
 
409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  30.77 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  31.25 
 
 
438 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  35.15 
 
 
394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  31.82 
 
 
431 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1072  beta-lactamase  35.13 
 
 
410 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22387  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  34.24 
 
 
397 aa  176  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  34.77 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  34.09 
 
 
397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  33.51 
 
 
391 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3473  beta-lactamase  32.98 
 
 
392 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  35.95 
 
 
398 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  35.95 
 
 
398 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  34.84 
 
 
396 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  34.51 
 
 
393 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  33.42 
 
 
396 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  32.74 
 
 
419 aa  166  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  34.09 
 
 
404 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>