More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5985 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  100 
 
 		 342 aa  704    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  35.49 
 
 		 462 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  33.52 
 
 		 477 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.01 
 
 		 442 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  33.73 
 
 		 487 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  31.06 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 559 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.92 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  33.44 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  29.78 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  32.93 
 
 		 356 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  31.25 
 
 		 578 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  29.25 
 
 		 537 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  30.87 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  32.67 
 
 		 543 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  32.67 
 
 		 543 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  30.39 
 
 		 848 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  26.95 
 
 		 470 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  29.07 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  30.05 
 
 		 481 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  29.22 
 
 		 362 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  29.5 
 
 		 514 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.85 
 
 		 593 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  32.08 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  29.95 
 
 		 463 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  30.24 
 
 		 496 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  29.12 
 
 		 481 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  29.61 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  29.12 
 
 		 481 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  29.54 
 
 		 603 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  29.14 
 
 		 611 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  29.12 
 
 		 481 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  27.51 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  28.12 
 
 		 446 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  30.77 
 
 		 483 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  30.14 
 
 		 483 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  30.81 
 
 		 490 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  27.41 
 
 		 547 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  30.06 
 
 		 498 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.29 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  29.86 
 
 		 483 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  28.08 
 
 		 513 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  27.49 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  30.19 
 
 		 415 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  29.83 
 
 		 483 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  29.02 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  31.25 
 
 		 416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  30.93 
 
 		 416 aa  126  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.55 
 
 		 421 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  26.15 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  27.11 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  32 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  29.22 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  26.96 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  29.22 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  29.86 
 
 		 544 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  29.22 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  27.27 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  25 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  27.42 
 
 		 367 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  28.15 
 
 		 453 aa  123  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  27.81 
 
 		 505 aa  123  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  28.71 
 
 		 422 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  25.95 
 
 		 466 aa  122  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  28.39 
 
 		 413 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  26.96 
 
 		 543 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  26.63 
 
 		 591 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  28.9 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.64 
 
 		 476 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  25.88 
 
 		 482 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  25.72 
 
 		 478 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  25.5 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  26.13 
 
 		 422 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  26.52 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  27.73 
 
 		 485 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  27.38 
 
 		 1055 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  25.81 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  27.8 
 
 		 434 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  26.55 
 
 		 485 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  25.83 
 
 		 517 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  29.69 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  26.35 
 
 		 498 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  27.52 
 
 		 485 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  26.35 
 
 		 498 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  29.69 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  25.49 
 
 		 530 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  27.67 
 
 		 1032 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  27.55 
 
 		 520 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  26.82 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  26.53 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4697  beta-lactamase  27.4 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.168974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  27.3 
 
 		 497 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  29.11 
 
 		 377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  25.95 
 
 		 485 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  29.69 
 
 		 377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.25 
 
 		 501 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  27.86 
 
 		 410 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1412  D-aminopeptidase  27.86 
 
 		 520 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  29.31 
 
 		 375 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  26.24 
 
 		 485 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>