More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3817 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  100 
 
 		 364 aa  744    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  40.46 
 
 		 496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0071  beta-lactamase  34.36 
 
 		 373 aa  239  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.844307 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.27 
 
 		 477 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  28.41 
 
 		 483 aa  133  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  26.59 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.22 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  30.12 
 
 		 462 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  27.25 
 
 		 342 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.71 
 
 		 559 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.38 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.04 
 
 		 367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  26.25 
 
 		 356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  23.24 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  26.3 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  27.09 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.3 
 
 		 543 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.3 
 
 		 543 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  23.17 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  27.38 
 
 		 543 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  31.89 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  28.83 
 
 		 793 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.66 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  25 
 
 		 470 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  29.91 
 
 		 366 aa  106  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  31.35 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  31.35 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  31.35 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  29.5 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  31.35 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.08 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  31.35 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  24.57 
 
 		 611 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  30.81 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  24.33 
 
 		 593 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  30.81 
 
 		 416 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  24.63 
 
 		 603 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  30.27 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  27.87 
 
 		 1055 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  24.55 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  30.5 
 
 		 415 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  26.62 
 
 		 364 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  28.72 
 
 		 371 aa  102  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  25.75 
 
 		 475 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  26.06 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  28.03 
 
 		 452 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  28.73 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  24.72 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  25.68 
 
 		 351 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  24.83 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  28.92 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  28.57 
 
 		 514 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  25.52 
 
 		 406 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  28.03 
 
 		 510 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  28.92 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  28.74 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  26.07 
 
 		 1032 aa  97.1  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25.75 
 
 		 578 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  27.44 
 
 		 497 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  27.27 
 
 		 848 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  25.69 
 
 		 482 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.39 
 
 		 480 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.88 
 
 		 520 aa  96.3  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  24.38 
 
 		 580 aa  96.3  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  25.6 
 
 		 338 aa  95.9  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  24.62 
 
 		 446 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  25.69 
 
 		 482 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  24.47 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  24.61 
 
 		 479 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  25 
 
 		 442 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  27.61 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  35.62 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  28.14 
 
 		 720 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  23.26 
 
 		 507 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  26.89 
 
 		 422 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  29.96 
 
 		 662 aa  93.2  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  24.68 
 
 		 486 aa  92.8  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  27.17 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  26.8 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  31.88 
 
 		 430 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  27.71 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  27.31 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  27.51 
 
 		 574 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  27.71 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  27.71 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  27.71 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  23.26 
 
 		 414 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  24.23 
 
 		 434 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  31.98 
 
 		 386 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.64 
 
 		 378 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  32.34 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  23.02 
 
 		 414 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  24.02 
 
 		 547 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0275  beta-lactamase  24.03 
 
 		 400 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.35061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  25.84 
 
 		 358 aa  90.1  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  26.58 
 
 		 321 aa  89.7  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  23.97 
 
 		 476 aa  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.63 
 
 		 669 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  22.96 
 
 		 513 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  26.37 
 
 		 480 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>